有机质中各种含硫化合物的总称。它主要来源于动植物残体和微生物细胞以及微生物的代谢产物。

有机硫含量与土壤有机质含量密切相关。它对土壤全硫的贡献则视土壤类型和土层而异。在热带、亚热带和温带湿润地区，在排水良好的非石灰性土壤的表土中，有机硫占全硫的90%～95%；随着剖面深度的增加，有机硫的含量一般均急剧降低。中国南方水稻土表土中，有机硫含量一般在100～400毫克硫/千克间，占全硫的82%～95%，其中太湖地区的水稻土有机硫占全硫的82.7%，四川盆地的水稻土有机硫占全硫的95%。华北平原潮土表土中的有机硫含量平均为80毫克硫/千克，占全硫的55%。盐土表土中，有机硫（132毫克硫/千克）仅占全硫的38%。

土壤中的有机硫化物除含硫氨基酸及其衍生物、硫氨素、维生素H外，绝大多数均有待分离鉴定。但按其化学稳定性的不同，可大致分为3类：①碳键硫或称阮来镍（Raney Nickel）可还原硫。包括含硫氨基酸及其部分衍生物，另外还包括一些有待鉴定的化合物。这类有机硫化合物以胱氨酸和蛋氨酸为主，其相对含量（占有机硫总量的%）随剖面深度而降低。表土中它一般变动在5%～54%间，平均为19%。其中排水不良的土壤较排水良好的高，森林土壤又常较草地土壤的高。这类有机硫较易分解释出SO，

是土壤硫营养的来源之一。②硫酸酯类硫或称氢碘酸可还原硫。在这类化合物中，硫是通过氧而不是直接与碳原子结合，它能被氢碘酸还原为硫化氢。这类有机硫包括芳基硫酯、烷基硫酯、硫酸化多糖、胆碱酸酯和酚硫酸酯以及硫酸化类酯等。其相对含量随剖面深度而明显增多。表土中它一般变动在25%～74%间，平均为50%，其中草地土壤常较森林土壤为高。这类有机硫，在土壤干湿交替时，酯键易断裂，释放出有效硫。它们是土壤中SO的主要来源之一。③惰性硫或称残余硫。它既不能为氢碘酸也不能为阮来镍所还原，包括饱和脂族磺酸和砜，还可能包括硫羟与醌、醛或糖的缩合物。其相对含量随剖面深度而增多。表土中它一般变动在3%～59%间（平均31%）。这类有机硫非常稳定，能耐受剧烈的化学处理，故其作为土壤潜在的硫源意义不大。