不同种、属或亲缘关系更远的物种之间的杂交。通过远缘杂交产生的杂种，称为远缘杂种。除有性杂交外，用生物技术将亲缘关系较远的植物体细胞融合而形成杂种的方法，也属于远缘杂交的范畴。

远缘杂交在一定程度上打破了物种之间的界限，促使物种之间的基因交流。与种内杂交相比，远缘杂交所获杂种的变异幅度大、选择范围广。它比种内杂交更能创造出超乎寻常的变异类型，有可能将不同种、属的优良性状集中于远缘杂种，形成全新的品种或类群。在生物进化过程中，远缘杂交是自然界新物种形成的重要途径之一，也是人工合成新类型、创造新品种的一个重要手段。目前世界上栽培的观赏植物，很多是由两个或更多的物种杂交，经过长期选育形成的。如现代月季是由开一季花的法国蔷薇（Rosa gallica）、百叶蔷薇（R.centifolia）、突厥属蔷薇（R.damasce-na）与原产中国四季开花的月季花（R.chinensis）、香水月季（R.×odorata）等10余个种经反复杂交长期选育出来的，这些品种集中了多个亲本的优良性状，其类型丰富、有色有香，是世界主要切花之一，也是园林中栽培的重要花木。此外，在石竹属（Dianthus）、唐菖蒲属（Giadiolus）、大丽花属（Dahlia）、木兰属（Magno-lia）、莲属（Nelumbo）、杜鹃花属（Rhododendron）、李属（Prunus）、丁香属（Syringa）、铁线莲属（Clematis）等种间、属间通过远缘杂交，产生了一些全新的类型，选出了很多优良的品种。远缘杂交结合胚培养、单倍体育种、异源二倍体加倍等处理技术，越来越扩大了观赏植物杂交育种的范围，提高了杂交结实率与杂种成苗率，并不断取得重要成果。

自然界不同种、属植物之间的天然杂交自古就有，但很少被人们记载下来。据查最早记载观赏植物远缘杂交的是中国宋代的范成大。他在梅花专著《范村梅谱》（约1187～1193年）中记载了‘杏梅’品种。‘杏梅’是梅花（Prunus mume）与杏（P.armeniaca）的杂交种，具有梅与杏双亲的性状。现代人工杂交证明了杏梅的杂种起源。观赏植物人工远缘杂交最早是在1719年，由英国人托马斯·费切特（Thomas Fairchild）用须苞石竹（Dianthus barbatus）与香石竹（D.Caryophyllus）进行杂交，并产生了远缘杂种（Fairchild mule）。以后香石竹育种得到较快发展。1870年，法国人又将石竹（Dianthus chinensis）与香石竹杂交，终于培育出了四季开花、香气浓郁的现代香石竹。在木本花卉方面，1894年法国育种家用紫叶李（Prunus ceracifera cv.Pissardii）与宫粉型梅花（Prunu smume cv.Alphanlii）杂交，培育出了常年呈紫红、重瓣大花的杂种樱李梅‘美人梅’（Prunus×blireana或P.mume cv.MeirenMei）。自1900年孟德尔遗传规律被重新发现以后，用人工远缘杂交培育新品种的方法已广泛应用，并创造出大量观赏植物的新类型和新品种。特别在梅花、玉兰、月季、山茶（含金花茶）、荷花、杜鹃花、兰花、牡丹、萱草等方面，取得了可喜的成果。随着细胞培养技术的发展，20世纪70年代以后，细胞杂交已在矮牵牛（Petunia hybrida）研究中取得了成功（Cocking 1976）。80年代以来，人们一直在探索用生物遗传工程技术来创造观赏植物新品种，如在中国，已于柑橘属（Citrus）与枳属（Poncirus）和金柑属（Fortunella）之间进行属间原生质体融合（细胞杂交）获得了远缘杂种。这个新领域的发展，为植物分子远缘杂交开辟了新途径，具有广阔前景。

远缘杂交一般结实困难；杂种生活力弱，育性差或完全不育；杂种后代分离幅度大，分离世代长，性状不稳定，这主要是由于遗传与生理障碍引起的。远缘杂交不亲和性有两类：一类发生在受精之前，称为配子不亲和性。一类发生在受精之后，称之为生理不亲和性。克服不亲和性方法通常有以下几种：①广泛测交，选择适当的品种做母本。同一杂交组合，用不同的品种作母本对杂交成功与否影响较大。因为同一物种不同品种之间的遗传差异对交配性影响很大，如在梅花与杏的杂交中，用江梅型品种比用朱砂型品种作母本能明显提高杂交结实率。②采用蕾期授粉、重复授粉或混合授粉等。母本柱头在不同时期接受花粉的能力是不同的，蕾期授粉、重复授粉有可能遇到最有利于受精的条件，从而提高杂交结实率，用异种、异属花粉混合授粉或在花粉中添加母本失活花粉进行授粉，也有明显的促进作用。中国在金花茶远缘杂交中应用此法，已获良效。③媒介法。当两个远缘的亲本直接杂交不易成功时，有时可选一个与这两个种都有亲缘关系的第三种植物作为媒介，把一个亲本先与媒介者杂交，再将杂种与第二个亲本杂交。由于媒介者大大缓和了双亲之间的生理生化差异，这样可能取得成功。④染色体加倍处理。在杂交之前，先将亲本之一或双亲的染色体加倍，然后再进行杂交，此种方法在草本植物中较易成功。⑤激素处理。利用赤霉素、萘乙酸、吲哚乙酸、水杨酸等处理母本柱头及授粉后的子房，对花粉在柱头上的萌发，花粉管生长及抑制杂种幼果早落有明显效果。如在梅花远缘杂交中应用赤霉素处理，已见显著效果。⑥截短柱头。截短柱头能起到缩短花粉管从柱头到胚珠的伸长距离，用此方法在百合远缘杂交中取得了成功。⑦胚培养。在远缘杂交中，由于遗传障碍和生理机能不协调，杂种胚在后期发育不良甚至完全败育，用幼胚的离体培养可以大幅度提高成苗率，梅花、百合、茶花等远缘杂交结合胚培养，已使杂交结实率成倍增长。

远缘杂种由于亲缘关系较远，在减数分裂时染色体不能正常联会，因此有时植株能正常开花，但不能结实。克服不育性（不稳性）的方法有以下几种：①染色体加倍。将杂种幼苗进行染色体加倍，可克服由于染色体不能正常联会而造成的不育性。因为加倍后的染色体可以正常配对，如多花报春与轮花报春杂交，其杂种不育。当染色体加倍成为异源四倍体后，杂种即可正常结实。②回交。当远缘杂交由于花粉败育而不能形成种子时，可考虑用回交法克服不育，不同回交亲本对提高杂种结实率有很大影响。选择回交亲本时，最好用同种的其他品种作为回交亲本，以避免远缘杂种迅速恢复轮回亲本的性状。③延长生育期。利用营养繁殖，延长杂种个体寿命。在有的情况下，可以使杂种的生理机能协调，恢复生殖机能，克服不育性。此外，加强杂种苗的田间管理，改善营养条件，以及摘心、针刺等处理，有时也对提高杂种结实率有一定的作用。

远缘杂种后代的性状分离强烈，分离世代长，分离类型丰富，不易稳定，为了克服杂种强烈分离，常常使用杂种一代染色体加倍和回交的方法，因为杂种染色体加倍后，可能成为表型不分离的双二倍体或异源多倍体，这不仅能克服不育，也能有效地促其稳定。同时，回交也是有效控制杂种分离的常用方法，在观赏植物育种中，远缘杂交应用较为广泛。因为大部分草本或木本观赏植物都能用营养繁殖方法进行繁殖，这就使性状固定迅速达成，大大缩短了育种时间。随着现代生物学技术的发展，远缘杂交中的不亲和性和不育性问题也正在逐步克服。此法在观赏植物育种中，将具有重要的意义和广阔的前景。