1939年秋在贵州省遵义成立，所址设在遵义来薰门外“百艺厂”旧址，为当时“中英文教基金董事会”（即中英庚款董事会）的自办事业之一。

研究所所长由原国立浙江大学生物系主任蔡堡教授担任。所内工作分育蚕及栽桑两大组；另设组织胚胎研究室、细胞遗传研究室、分析化学实验室、细菌实验室、生理实验室等。

当时正值抗日战争时期，条件十分困难。但该所派专人到上海及各地购置了各种必需的仪器、药品及图书数千册，俾能开展工作。该所进行的主要研究工作，在桑蚕方面，一是收集了当时能从各地收集到的桑蚕种，约有数十个品种，进行了大量的杂交育种工作，还进行了桑蚕的遗传学方面的基础理论研究；二是对桑蚕的组织胚胎、细胞、生理、生化、病害等，也作了大量的研究工作。在栽桑方面，收集了当时可能收集到的桑品种数十个，在研究所附近栽种了20余亩的桑品种标本园和实验桑园。

该所有中级科研人员20余人。多为当时浙江大学、中央大学、西南联大的理学院及农学院毕业生，并培养了练习生20余人。还有工人约10余人。当时虽然生活艰苦，工作条件差，但在抗战精神激励下，从事栽桑、育蚕、实验、调查、研究的工作人员情绪极高。该所定期举行读书报告会，工作、学习、科研蔚然成风。建所第3年，即1941年，将上述几方面所得的研究成果，整理刊印了《中国蚕桑研究所汇报》第1卷第1期，计研究论文、工作报告、研究简报共20篇。1942年刊印了第1卷第2期，计研究论文10篇。1943年刊印了第1卷第3期，计研究论文9篇。

中国蚕桑研究所出版物

1945年抗日胜利后，中国桑蚕研究所迁到杭州。在杭州庆春门外华家池借浙江大学农学院土地建立新址，继续开展工作。1949年该所由浙江省人民政府接管，改为省农林厅蚕桑试验场。