研究动物繁殖过程中免疫现象的一门新兴学科。其目的是揭示这些免疫现象的分布、产生条件和作用机制。梅契尼柯夫（И.И.Мечников）关于天然抗体对精子有害作用的发现，吞噬作用的理论的形成和克服种间杂交不相容性及预防胚胎死亡的方法的制订，奠定了繁殖免疫的基础。免疫现象参与公母畜正常繁殖的所有的过程，对配子的形成、精子在生殖道的运行、受精、胚胎的早期发育、泌乳和幼畜生后的发育具有重要的影响。繁殖免疫方面的研究不仅能揭示繁殖过程的机制，而且为调控繁殖过程开辟了新途径。

精子的抗原性相当复杂，包括精子特异抗原、精子包被抗原（精液抗原）、血型抗原、组织相容性抗原和酶抗原等。由于精子具有抗原性，多次交配如同重复免疫接种，会引起母体抗体滴度升高，成为繁殖力降低的原因之一。雌性动物生殖道（主要是子宫颈、子宫和输卵管）内局部对精子抗原的反应，与不孕的关系极为密切。Y-精子具有特异的H-Y抗原，如为母畜接种H-Y抗原，使之产生免疫力，则排斥Y-精子参与受精。或用H-Y抗体处理精子，抑制或杀死Y-精子，受精后雌性后代占70%左右，是性别控制的免疫学方法之一。雄性早期胚胎的表面也有H-Y抗原。胚胎间接荧光分析法可鉴别早期胚胎的雌雄，进行选择性的胚胎移植，达到控制性别的目的。

免疫系统对自身组织成分通常表现为耐受性，但由于外界环境的影响（病原体的侵入、各种理化因素、药物等），机体内环境的紊乱、体细胞的突变等，均可使机体的自身耐受性终止而表现出自身免疫性，产生自身免疫性疾病。母体患有某种免疫性疾病，在妊娠期内，如胎盘遭到破坏，这类抗原则能进入胎儿体内，侵犯相应的组织和器官，引起胎儿发生同样的疾病。

红血球具有表面血型抗原。当一个动物的红血球进入另一个动物体内时，若是供体红血球带有受体没有的抗原，由于天然同族抗体的存在和异型红血球抗原结合，可使红血球发生凝集和免疫溶解。在家畜中，免疫溶血主要发生于骡驹。母马妊娠后受到骡胎儿的抗原刺激，产生抗骡红血球的抗体，这种出现于妊娠末期母体血液中的抗体，于产前进入初乳，当新生骡驹吮食含高效价抗体的初乳后，抗体进入血液循环，引起溶血。根据同一机理，也可能发生白血球（主要是中性白血球）和血浆同种异性免疫。

除了自身免疫性疾病和母胎间血型不合造成胎儿发育受阻或死亡外，母体淋巴细胞对胎儿组织抗原的过敏反应，也妨碍胎儿的正常发育。

用激素抗体或以激素为抗原给动物进行被动或主动免疫，中和内原相应激素的生物活性。根据这一原理开发出一种激素免疫技术，以甾体激素为抗原配以适当的佐剂，制成疫苗，在繁殖季节到来之前，为适繁母绵羊免疫，可提高双羔率20%左右。