种群是渔业资源计量的基本单位。科学地鉴别种群，不仅是开展资源定性定量研究的前提条件，也是渔业资源能够获得合理利用的基本保证。

种群的研究是从19世纪后期德国海洋生物学家汉茵克（F.Heincke，1878、1898）调查北欧的鲱洄游开始的。最初他借用研究人类学的量度法，后又用计数法（椎骨、棱鳞）分析了6000余尾从北欧各海区采得的样本。发现各海区的鲱可以分为10多个种群，它们都有自己特定的洄游分布区。20世纪初丹麦鱼类学家斯密特（J.Schmidt，1930）曾采用计数法（椎骨、第二背鳍鳍条）分析了两万余尾大西洋鳕的样本，认为该鱼亦可分为10多个种群。此后许多国家其他学者采用各种方法对各种鱼类种群开展了广泛的研究。中国学者60年代以来对中国近海的大黄鱼、小黄鱼、带鱼等种群也开展了比较深入的调查研究。

种群鉴别方法很多，除用于鲱及鳕等计数、量度的生物测定学方法之外，还有生物化学方法，常用的有血清凝集反应法和分子生物学法。前者当抗血清滴入原来制造抗原的鱼蛋白时，血缘近的会产生混浊沉淀，血缘远的便不会产生混浊沉淀。后者是基于不同种群鱼类的蛋白质电荷迁移率存在差异而进行的。具体做法包括肌浆蛋白电泳、血红蛋白电泳以及各类同工酶的电泳等。此外，生态学方法亦常被用来区分鱼类的种群，如测定鱼类鳞片与耳石的轮纹特征、鱼群的生长曲线和寄生虫的寄生状况等。另外，利用逐月大面定点试捕和渔获统计资料，以及鱼类标志放流资料，也可作为鉴别鱼类种群的依据。

生物测定学是鉴别鱼类种群的最常用方法。它主要是利用鱼体本身的计数和量度特征，亦称天然标志法。此法用于计数的项目主要有椎骨数、各鳍的鳍条数、侧线鳞数、鳃耙数、幽门盲囊数等，通过计数后计算各项特征的计算平均值和标准偏差。用于量度的项目是鱼体各部分的大小比例，如体长与头长之比，头长与眼径、吻长之比等，然后按鱼体大小分组进行统计。取样要取自种群隔离水域，即产卵场的样本；也可采取越冬场的样本作为对照。取样数量每批以取几百尾包括各龄鱼的混合样本为好。所采样本要求个体完整。对取得的成鱼样本一般腹腔需注射固定液，对幼鱼样本最好能作染色等处理。

计数和量度数据由于是人工测定，往往会有测定误差。故在进行此项调查时，应制订统一的测定规范，测定人员必须事先经过严格的训练，而且要建立严格的校对制度。测定完的样本要编号保存备查。

计数特征往往会出现变异。通过实验生物学的长期研究，已确认是早期发育环境水温差异造成。大多数鱼类低温能使体节数发育得较多。各项计数特征的形成时间也有先有后，如椎骨数一般在胚胎期即已形成，而鳍条数则要在孵化后几天甚至几星期内方能形成。因各年的水温有差异，故采取混合样本可增强数据的稳定性。因为是根据计数特征的差异来进行鉴别的，所以一定要选择易产生差异的项目作为研究指标，一般只要选几个容易变异的项目进行测定就可以鉴别。计数特征出现频率的分布规律，不少学者认为它符合正态曲线（即高斯定律）。因此，可用统计方法来判别计数特征之间的显著差异性。