不同品系、不同品种，甚至不同种属间的某些杂交组合，其杂交子一代（F₁）往往具有比双亲更快的生长速度、更高的抗逆性和对环境的更强适应力。但是，这些杂交子一代相互交配所产生的后代的性状将出现分离，杂种优势也将下降。

在淡水养殖鱼类中已有相当多的组合表现出明显的杂种优势，有些已在生产上取得经济效益。远缘杂交中表现出杂种优势的有：鲤×鲫、团头鲂×长春鳊、鲢×鳙，细鳞斜颌鲴×黄尾密鲴和鳇×小鲟等。种内品种间的杂交除金鱼及锦鲤等观赏鱼之外，在生产上取得效益的均为鲤品种间的杂交。在中国形成生产力的鲤品种间杂交组合有：“丰鲤”（兴国红鲤♀×散鳞镜鲤♂）、“芙蓉鲤”（散鳞镜鲤♀×兴国红鲤♂）、“荷沅鲤”（荷包红鲤♀×沅江野鲤♂）、“岳鲤”（荷包红鲤♀×湘江野鲤♂）及“三交鲤”（荷沅鲤♀×散鳞镜鲤♂）等。

常用方法有：①单交（single cross）。同一品种的两个不同纯系间的杂交，或两个不同品种间的杂交。②正反交（reciprocal cross）。两个种或品种间交替作为父母本的杂交。若鲢♀×鳙♂称为正交，则鳙♀×鲢♂称为反交。③回交（back cross）。杂交子一代与亲代的杂交，其子代称为回交子一代（BC₁）。④三杂交（triple cross）。杂交子一代与另一品种的杂交。如三杂交鲤就是荷包红鲤♀×沅江鲤♂的子一代（F₁）与散鳞镜鲤杂交所产生的杂种。

杂种优势的遗传学解说有两种主要理论，即显性论和超显性论（也可称为杂合论）。显性论者认为杂种优势的产生是由于在基因座位不断纯化过程中有利显性基因的相互补充的结果，杂合性本身不是产生杂种优势的原因；超显性论者则认为控制生长及生活力性状的基因座位在杂合的情况下，不同等位基因相互作用有刺激生长和适应较复杂环境的能力。因此超显性论认为杂种优势完全决定于杂合性，两者是一种直接的关系，如果一经纯合化，杂种优势便将消失。从理论上讲，不可能把最优的杂合基因型固定于一个纯系中且世代相传下去。

总之，杂种优势的强弱与双亲间的基因型差异有关，差异愈大，优势愈显著。当杂交的一个亲本在任一位点上是这一等位基因的纯合体，而另一亲本在该位点上是另一等位基因的纯合体，这时双亲的基因型差异最大，产生的杂种优势也最强。这就是为什么在杂种优势的利用中要求培育不同纯系和不同纯种作为杂交亲本的道理。如果杂交双亲的基因型没有差异，也就不会产生杂种优势。

杂种（F₁）的平均性状值超过双亲（纯系或纯种）的平均性状值的部分是杂种优势值，可用下列公式计算。

鱼类杂种优势

在估算杂种优势时，要分别了解正反交杂种（F₁）的性状值，因为由于母本遗传影响，正反交杂种（F₁）的杂种优势是可能不一样的，甚至出现正交杂种（F₁）有杂交优势，而反交杂种（F₁）却没有杂种优势的现象。

杂交子一代如进行自交，其杂交子二代（F₂）的性状就会出现分离，随之杂种优势下降，这就是近交衰退现象。

杂种优势可直接应用于生产，使产量明显提高。对于有繁殖力的杂种，在生产上只能应用杂交子一代，因为从杂交子二代就开始出现杂种优势衰退和性状分离。同时放养杂种（F₁）时要严加控制，应在性成熟前捕净，以避免它与相近种类杂交而导致原有种质资源遭受破坏。