有目标地汇集种质资源，是资源研究工作内容之一。收集可以通过普查、专类收集、国内征集、国际交换等途径进行。收集后的种质资源要置于适当条件下保存。

引种是收集种质资源的一条重要途径，一些国家长期坚持国外引种颇见成效。美国从1776年起即开展有组织的国外引种，仅1839～1979年就引入各种作物的种质资源43.8万余份。苏联全苏作物栽培研究所，在20世纪60年代中期至70年代中期，考察了50多个国家，获得各种作物的品种资源13万份。

种质资源的收集具有广泛性和长期性的特点。以收集种质资源为目标的引种、与引入良种用于生产不尽相同。种质资源的收集，无论从目的或范围来说都更为广泛，着眼于为培育质量更高的新品种提供充分的物质基础。收集的范围包括栽培品种中当前栽培和过去栽培的品种；地方品种，近缘野生种、野生种，以及具有潜在利用价值的类型，杂交优系，芽变系等等。种质资源的收集是一项经常性的工作。为充分发掘有用的种质资源，提高收集的效果，要了解它的起源、传播及分布：预测生产和育种实践对种质资源的需求。

种质资源收集工作之前要做好充分准备，了解情况，制定计划，避免盲目性。收集的过程中要按资源调查和引种的要求，填写调查项目记载表。对资源的名称、特性、产地、立地条件等详加记载，同时应摄影并采集标本。

果树种质资源可供收集的材料有接穗、插条；苗木，根蘖，以及种子等。不论收集苗木、枝条或种子，都必须保证纯正和具有正常的生活力。收集的时间应在一年当中适宜繁殖的时期进行。一般以冬季引入苗木或休眠枝条，经短期贮存后，春季进行栽植或高接。夏季引入接穗，由于气温高，包装及长途运输不便，芽接后影响成活。在自然条件发生特殊变化的年份，提供了在特定的环境条件下收集某些特殊类型的可能性。如在病害发生严重的年份收集抗病类型；在冬季严寒的年份收集抗寒类型等等。

资源收集之后，要隔离繁殖，经观察若干年后才能入圃保存。从国外引入的种质资源，更要严格检疫，经检疫后再进行隔离试种或高接观察，防止危险病虫传入蔓延。

引入种质资源的编号、登记工作十分重要。编号应按统一规定。中国习惯于采用引入年份加引入顺序的编号方法。美国从1898年起对从国外引入的各种作物，不分种类统一编植物引种号（Plant Introduction Number），简称P.I.Nu.编号。日本采用永久编号法，不同作物按种类编号，以六位数字表示；科、属、种各用两位数表示。同一作物按品种编号，也采用六位数字，前两位数代表从何处引入，后四位数为品种编号。从保存名单的编号上，就可以看出该资源材料的分类地位和引入地区。除编号之外，还要在特制的资源引种卡片上进行登记，记载资源的编号、收集途径和时间、检疫情况、繁殖及保存情况等有关内容。欧、美许多国家早已采用电脑贮存资料，80年代以来，中国发展也很快，电脑存贮，便于查询、利用和交流。