位于接穗和基砧之间的一段砧木。是砧木的一种利用方式，用于二重或多重嫁接，其成苗称中间砧果苗。一般是二重嫁接形式，果苗由品种接穗、中间砧、基砧3部分组成。由于矮化砧繁殖困难，繁殖系数低，根系发育较差，所以将具有某种特性的砧木枝条用作中间砧，利用基砧根系发达，固地性、抗性、适应性强，采种繁殖容易等优点和矮化砧木对接穗的影响，共同作用于接穗品种，以达到矮化树冠，提早结果，增进果实品质，提高树体适应性和抗性的目的。例如以安托诺夫卡或法国海棠枝条作中间砧，能提高主干的抗寒性和抗腐烂病能力；用哈蒂和故园（Old Home）等西洋梨品种的枝条作中间砧，使榅桲和大多数梨品种能够亲和，成功地培育出梨的矮化砧果苗；还有在矮化中间砧上再加一段有某种抗性的砧木枝条作中间砧，这段中间砧称干砧（body stock），是多重嫁接形式，果苗由品种接穗/中间砧（干砧）/中间砧/基砧4部分组成，达到集矮化、抗性于一体的目的。

以中间砧形式利用矮化砧木，培育矮化中间砧苹果苗，已为中国、日本等主要苹果生产国广泛应用。苗木的常规培育过程是，选择当地适宜的苹果实生砧木作基砧，在实生苗近地面处嫁接矮化砧木作中间砧，翌年再于矮化中间砧枝段的25～35厘米处嫁接苹果品种，培养出成苗。这种方式育苗节省矮化砧木种条，苗木质量较好，但育苗时间需要3年。如采用双芽靠接方法，可2年育出成苗，但需加强基砧的培育措施。矮砧种条较充足，可采取二重枝接或分段芽接方法培育矮化中间砧苹果苗木，育苗期缩短1年，但操作技术较为复杂。中间砧的长度在一定范围内与矮化、早果效应呈正相关，因此其长度不应短于25厘米。如用作抗性砧，长度要加大，用做亲和砧则1～2个芽子已达到要求。

利用中间砧方式培育果苗，虽技术较繁、成本较高，但对树体有明显的良好影响，生产上经济效益也高，值得提倡。育苗中根据要求选择适宜的砧穗组合，并注意改进育苗技术。