采用各种机械设备对种子进行加工处理的过程。

19世纪60年代，德国、美国和丹麦等国就开始生产种子清选机，其后许多国家又研制出多种不同原理的种子清选机。并从简易式发展到复式、从单机作业发展到成套的种子加工机组。20世纪40年代，美、法等国家开始建成种子加工厂。随着种子生产专业化和流通商品化的发展，许多发达国家都建立了现代化的种子加工厂，机械化程度和加工项目也不断发展，不仅实现了由原材料进厂到成袋包装的商品种子出厂的全部机械化，有的还包含机械化处理工序。中国20世纪50年代末开始生产复式种子清选机，70年代末成批生产了重力式种子精选机，并形成了系列产品；还生产了20多种不同型号与用途的种子清选机械。同时，也从国外引进并开始研制种子加工厂的成套设备。用机械清选种子不仅生产率高，而且分选质量好，能减少田间病虫和杂草的危害。

种子加工工艺通常分为种子预处理、种子清选分级和种子后续加工三部分。除采用一些相应的机械设备外，输送机、计量设备、包装机、缝袋机等辅助机械设备应用也较普遍。

种子预处理

包括种子干燥、棉籽脱绒、甜菜子剥裂、带芒种子除芒、浆果取籽等。某些谷物干燥设备如远红外辐射干燥机等可用于种子干燥，但种子温度不得高于35～43℃，一次降水量也应低于食用谷物。棉子脱绒方法有机械脱绒（见棉子脱绒机）和化学脱绒（见棉籽硫酸脱绒设备）两种。

种子清选分级

从种子中清除夹杂物，并分选出符合要求的优良种子。所用机械有气流式、筛选式、风筛式、窝眼式、重力式、摩擦式、磁选式、电选式和光电色选式等种子清选机。

种子后续加工

包括高低频电流处理（见高低频种子处理机）、γ射线和激光照射、包衣和丸粒化处理等。种子经过高低频和照射处理后，在提高发芽率、促进早熟、改善品质和增产等方面有一项或多项明显的效果。有的国家已将钴60同位素作为γ射线源用于种子加工厂。包衣处理是用机器在种子表面以基本不改变外形的情况下外裹一层含有农药等物质的速干胶状物，播种后可以防止虫害，促进生长，或用农药、肥料、吸水剂、增氧剂、激素和适当的添加剂，把种子包成丸粒状或饼状，使表面粗糙、形状复杂的种子改善流动性，使小粒种子粒径增大，有利于精量播种。制成饼状的小粒种子采用飞机播种，可提高投放准确度和着地稳定性。各种外裹物料为种子创造良好的发芽和生长条件（见种子包衣机）。

将种子物料按质量要求，采用科学的工艺流程，经过多种机器连续加工，最后定量包装成商品种子的工厂。它是在杂交玉米等推广后，种子需求量大、精量播种要求对种子严格分级的情况下，由单机到联机、到成套机组的基础上逐步演变过来的。种子加工厂是重要的农业生产资料生产的新兴工业部门，60年代以后发展很快。厂房结构与机具布置的方式有立体式、平台式与平面式三种。立体式为高层建筑，在各层建筑内按工艺顺序安置各类加工机械，种子被提升到顶部后，靠重力自流作用输送到各机器。为了避免种子被提升的层次过高，可采用分段提升的办法（图）。

分段提升式种子加工厂流程图

种子加工按加工种子对象的不同分为通用厂与专用厂。通用种子加工厂配备的机具较完全，输送管路采用多种流程，可依据加工对象选用其中的机具和管路。专用种子加工厂按所加工的种子命名，如玉米种子加工厂、蔬菜种子加工厂、牧草种子加工厂、棉花种子加工厂等。除了作物单一、种子培育集中、种子加工工艺固定的地区外，一般多为通用厂。因为加工不同作物种子的主要机型差别不大，只要多配备几台特殊用途的机器就可扩大种子加工范围。不同加工对象的差别主要也反映在前处理过程。批量较大的种子用箱式烘干机，批量小的可成袋烘干。在玉米种子加工厂中，来料是果穗时，就用烘干室烘干，并需配备玉米剥皮机和脱粒机等。有些作物种子在加工前还需增加一些工序，如对水稻、大麦、燕麦、蔬菜和牧草中的某些品种要脱芒去毛，对棉籽要脱绒等。在前处理中是否需要初清选视来料含杂情况而定。初清选作业多采用生产率较大的风选机和孔眼较大的粗筛，并安排在烘干之前进行，以改善种子在烘干机中的流动性和减少热能消耗。不同作物种子的其他工艺过程和所用机具基本相同，安排顺序为：清选（平筛或旋转筛）、分级、窝眼清选、重力清选、拌药、称量装包、缝袋等。现代化种子加工厂有集中的操作控制室，任何环节发生故障时都能自动报警和灯光显示，并自动停机。工厂化加工种子不仅质量好，而且生产率高。