五脏之一。位于腰部，左右各一。临证中一般称肾脏为内肾，睾丸为外肾。肾的病变常反映到腰部，故有“腰为肾之府”之说。由于肾藏精，主管机体的生长、发育和生殖，所以称“肾为先天之本”。其经脉络膀胱，与膀胱相表里。

功能：①主藏精。《元亨疗马集》：“兽之精气归肾。”精包括生殖之精和五脏六腑之精。前者是肾本身之精气，是构成生命的基本物质，它与机体的生长、发育、衰老、生殖等有关；后者由水谷化生而来，贮存于肾，是维持生命活动的物质基础。生殖之精和五脏六腑之精相互依存、相互促进，前者有赖后者的不断充养，才能继续发挥作用；后者又需前者的不断资助才能得以化生，故一方的不足，必然影响另一方的功能。②主命门火（简称命火），亦即肾阳。是生命本元之火，寓于肾阴之中，是性机能和生殖能力的根本。它有激发促进生长、发育、生殖和各脏腑功能活动的能力，特别是脾胃需要此火的温煦，才能发挥其正常的运化功能。命门火不足，会导致机体全身阳气的衰弱。肾所藏之精属阴，即肾阴（又称元阴、真阴、肾水、真水），命门火属阳，即肾阳（又称元阳、真阳、真火、先天之火）。二者是肾脏生理功能活动的两个方面，彼此依附为用。肾阴是机体阴液的根本，对机体起着濡润、滋养的作用；肾阳是机体阳气的根本，对机体起着温煦、化生的作用。二者相互依存、相互制约，共同维持其动态平衡。一方的偏盛或偏衰，必然累及另一方而导致平衡的失调。③主水。肾与肺、脾同司机体的水液代谢，是机体水液代谢的重要器官。《司牧安骥集》：“肾者，水为脏”，“肾为水海。”肾阳的气化作用能升清降浊，通过三焦将津液输布全身；通过膀胱将无用之水液变成尿液而排出体外。若肾阳不足，气化失常，就会引起水液代谢的障碍，从而发生水肿、腹水等症。④主纳气。由肺吸入之清气，必须纳藏于肾。肾气充足，摄纳正常，则能助肺行呼吸，使呼吸平顺调匀，故有“肺主呼气，肾主纳气”之说。肺司呼吸，为气之本；肾主纳气，为气之根。肾气充足，元气固守于下，才能纳气正常。若肾气不足，元气不固，纳气失常，影响肺的肃降，即可出现动则气喘，呼多吸少的喘息证候。⑤主骨，生髓，通于脑。肾藏精，而精生髓，髓能充养骨骼，资生脑髓。肾精充足，骨髓生化有源，故骨骼坚固有力。若肾精亏虚，则骨发育不良，脆而无力。《活兽慈舟》：“肾华在齿。”《诸病源候论》“牙齿病诸候”：“齿是骨之所终，髓之所养。”所以，牙齿也有赖肾精的充养。肾精充足，牙齿坚固有力；肾精不足，则牙齿松动，甚至脱落。髓上达而聚于脑，故有“脑为髓之海”，“诸髓者皆属于脑”之说。临证中见到某些病畜头低耳耷，眼闭无神，对刺激反应迟钝等，往往也与肾精不足有关。⑥开窍于耳，司二阴。《司牧安骥集》“马师皇五脏论”；“肾者外应于耳。”听觉依赖肾气的充养，才能听力正常。肾虚可致听力减退，甚至耳聋，采用补肾的药物治疗，常能使听力恢复。肾还开窍于二阴（即前阴和后阴），前阴有排尿、生殖的作用，后阴有排粪的功能。临证中出现的尿频、尿少、尿闭以及垂缕不收（阴茎麻痹）、阳痿、久泄脱肛、阴虚便秘等症，有时可从肾论治。