1962年成立。第一届理事会由45人组成，1978年第二届理事会由105人组成，两届理事长均为金善宝，1983年第三届理事会由97人组成，理事长李竞雄。1988年第四届理事会由93人组成，理事长庄巧生。

中国作物学会为多学科、多专业的学术性群众团体。1986年经中国科学技术协会批准为一级学会，下设耕作制度、栽培研究委员会，大豆、麻类、甘蔗、谷子专业委员会，随后又陆续成立了遗传资源研究委员会和马铃薯、大麦、油料作物专业委员会。各省（自治区）、市也随之成立了作物学会，有的省（自治区）、市还建立了相应的二级组织。

学术活动方面，自1978年学会恢复后，举办中小型学术讨论会20余次，收到学术论文累计1400余篇。其中1979年由中国作物学会牵头会同中国植保学会、中国棉花学会召开了农作物抗病育种学术讨论会，探讨了多抗性育种问题；1980年召开的农作物栽培学术讨论会，提出了“加强农作物栽培科学研究工作的意见”的建议。还多次举办耕作制度学术讨论会，为逐步完善中国的耕作制度作了理论上的探讨。其中北方旱地农业学术讨论会为开拓大西北和干旱—半干旱、半湿润易旱地区的农业进行了理论研究。同时召开了农作物杂种优势利用，甘蔗、小杂粮、小油料、小杂豆等学术讨论会，进行了全国大豆学术讨论会（每4年1次）及分年、分区大豆科研生产考察。在国际交流方面，接待了日、美、澳等国民间组织的农业学术团体；派员参加在澳大利亚召开的国际旱农会议；水稻抗病育种考察团在日本进行多次交流，回国后组织了粳稻的抗病育种协作。1985年由我国举办的国际多熟制学术讨论会，有来自国际玉米小麦改良中心、国际热带作物研究所和国际水稻研究所等研究机构的代表参加。

学会与中国农业科学院作物育种栽培研究所合办的《作物学报》，自1962年发刊以来，已出版11卷。1985年还创办中级科普刊物《作物杂志》，使学术界的普及与提高工作密切结合起来。