由细菌、真菌、病毒等的侵染而造成对芝麻的伤害。芝麻病害种类很多，据报道国外近40余种，中国已记载的有23种。其中茎点枯病、枯萎病、青枯病、疫病、病毒病等为害较重，估计常年产量损失10～20%，含油量下降2～5%。

是世界各产芝麻国普遍发生的病害，也是中国芝麻产区为害最严重的病害。分布于河南、湖北、安徽、江西、江苏、台湾、山东、浙江、福建、广西和河北等省（自治区）。发病愈早，损失愈大。病株株高降低，蒴果数减少，千粒重和含油量均下降；7月份前枯死的病株，颗粒不收。

此病在整个生育期内都可发生，但是主要发生在盛花期以后。种子及幼芽感病在土中即可引起烂种及烂芽，幼芽及幼根感病后变褐色，其上产生黑色菌核及分生孢子器，幼苗萎蔫枯死。成株期为害多自根部或茎基部开始发生，有时也在茎秆局部首先发病，而后再向病部上下蔓延，很快绕茎一周，变成黑褐色，以后病斑中部变成银灰色，有光泽，密生许多小黑点。撕开表皮，皮层及髓部密生黑色小菌核，以后髓部中空易折倒。蒴果、种子、叶片也能被害。叶片感染后自下而上发黄变褐，并向上卷缩萎蔫。种子病部则产生许多黑色小点。

病菌主要以菌核和分生孢子器在种子、病残株和土壤中越冬，而以菌核为主要的初次侵染来源。菌核能在土壤中存活达两年之久。病菌通过伤口或从茎基部的衰弱部分、根部以及叶痕处侵入。病株上的分生孢子借雨水及气流传播，反复侵染。在芝麻生育期间，有两次为害期。第一次播种后3～7天开始至现蕾初花期，第二次在盛花期至成熟达到发病最高峰。芝麻茎点枯病菌是一种弱寄生菌，它的寄生性和致病性与寄主植物的生长状态和环境条件有密切的关系，降雨量是影响发病的重要条件，芝麻受渍受旱病害就会严重发生。

世界芝麻产区普遍发生。中国主要分布在河南、湖北、江西、吉林、内蒙古、陕西、山西、河北和新疆等省（自治区）。被害植株全株提早枯死或个别枝条枯死；种子不成熟、瘦瘪，蒴果开裂而造成减产。发病严重的田块，发病率常高达30%以上，是中国芝麻生产的主要病害。

芝麻从苗期到成株期都能感病，幼苗发病，全株猝倒。成株期发生较多。病株根部变褐、腐烂，叶片自上而下变黄枯萎，或全株枯死，茎基部变红褐色，有的往往限于半边或部分根系变褐，并顺茎部向上伸展使相应的半边植株叶片变黄枯萎，呈现半边黄现象。茎部红褐色干枯的条斑，潮湿时，病部可长出一层粉红色霉状物（病菌孢子）。两种病菌形态相似，但致病性不同，前者能够侵染多种植物，后者只能侵染芝麻。病部粉红色霉层是病菌分生孢子和菌丝体，最适宜的生长温度为30℃。

病菌在土壤、病株残体和寄附在种子内外越冬。从芝麻苗的根尖和伤口侵入，沿植株导管向上蔓延到茎、叶、蒴果和种子。一般6月开始发病，8月达到发病盛期，尤其是在雨水多、土壤湿度大或土壤瘠薄的砂壤土上发病严重，品种间抗病性有差异。

主要发生在中国南方芝麻产区，江西、湖北、广西、甘肃等省（自治区）及北方产区均有发生，但为害较轻。芝麻染病后，整株很快萎蔫枯死，发病越早，损失越大。病株初期茎部出现暗绿色斑块，逐渐变成黑褐色条斑。病株叶片从顶端向下急剧萎蔫，老叶挂垂，继而全株枯死。病株根茎内维管束变褐，且逐渐蔓延到髓部，造成空洞，茎部内外均有菌脓溢出。病叶叶脉呈黑绿色条斑，纵横交错成网状。染病种子瘦瘪变污褐色，不能发芽。

病原细菌喜高温，发育最适温度为28～33℃。病菌在种子及病株残体上于土中越冬，可在土壤中存活一年以上，甚至长达3～5年以上，从根部伤口和自然孔口侵入，田间靠流水、带菌肥料或农活操作传播。此病的发病高峰多在炎热的7月至8月份，暴雨骤晴天气发展最快。

印度、埃及、委内瑞拉、墨西哥、尼日利亚、坦桑尼亚等国的芝麻产区均有分布。中国在湖北、江西、河南、山东等省都有不同程度的发生。发病后常连片枯死，是一种毁灭性病害。该病多发生在芝麻生长的中后期（7月至8月），为害茎部，造成顶端嫩梢卷曲。茎秆明显干缩溃疡，形成一段绕茎的缢缩病斑，初呈深绿色水渍状，后变成黑褐色。在潮湿情况下，可长出绵状白霉。叶片感病形成淡褐色大斑块，并微有轮纹；潮湿时叶背病斑外缘也能产生霉轮（病菌的子实体）。病斑的组织很薄，易于干缩、枯焦，叶片歪曲畸形。

病菌生长最适宜温度为28℃，以菌丝或卵孢子在田间病残体中越冬。次年病菌首先侵染芝麻茎基部，形成初次侵染，然后在病部形成分生孢子，借风雨、流水传播蔓延，进行再侵染。芝麻疫病在芝麻现蕾时开始发病，8月份大发生，多雨潮湿的气候有利于发病。

防治措施主要是采取轮作、选育抗病品种，加强田间管理，结合药剂防治。