由于温度、水分、风等气象因素的不足、过多或不协调而使小麦生育严重受抑或死亡，从而降低产量或品质的自然灾害。常见的小麦气象灾害有越冬期间的冻、雪、冻涝、冰壳害；春季拔节期的旱害、晚霜害；抽穗开花期的冷、旱害；灌浆成熟期的干热风、冰雹、高温、阴雨害等。中国北方麦区主要是旱害、冻害、干热风害。南方主要是湿害、冷害、阴雨害等。

小麦生育过程中若水分不足，生长发育就会受到抑制；严重缺水时还会造成死苗、青枯或影响结实，从而降低产量甚至绝收。小麦播种后，种子含水量达到其干重的35～45%才能萌发，要求适宜的土壤水分为田间最大持水量的60～70%。土壤水分不足时首先影响出苗，或虽出苗但幼苗细弱，根系发育不良，分蘖少。中国北方冬麦区的伏秋旱，春麦区的春旱，都会成为播种期的旱害；冬小麦越冬期间，幼苗生长缓慢或基本停止生长，易发生冻害，此期若遇干旱往往加重其冻害。冬小麦返青至拔节期，春小麦3叶期到拔节是小麦营养生长的重要时期，此期的春旱会影响小麦的生长和穗分化，使其植株矮小，叶面积小，穗粒数少。拔节后孕穗阶段，是小麦需水的临界期，也是小麦一生耗水的高峰期，这一时期的耗水量约占小麦一生总耗水量的30～35%。干旱会使小麦的成穗率和结实率降低，对产量的影响最大。抽穗至成熟，特别是乳熟阶段，小麦的需水量也较大，此时遇旱会影响小麦籽粒灌浆，千粒重下降。

冬小麦一生耗水450～600毫米，春小麦375～450毫米。不同产量水平耗水量不同。在适宜范围内，小麦产量随供水量的增加而增加。但达到一定数量后，水分增加产量反而降低。黄河以北的华北地区，冬小麦生育期间若供水量大于600毫米，产量会下降。中国北方冬麦区年降水量为450～900毫米，西北春麦区在400毫米以下，北方春麦区不足600毫米，而且多集中在小麦收获以后的夏季。北方冬麦区小麦生育期间的降水量为150～250毫米，西北春麦区不足200毫米。特别是小麦需水的高峰期，即3月至5月份，降水量更少。华北地区3月至5月份的降水量一般在60毫米以下，春旱十分严重，有“十年九春旱”之说。历史上此期出现旱灾年份的频率也最高，对小麦产量威胁甚大。但华北平原和西北黄土高原地区，夏季降雨量为年降雨量的50～60%，土层深厚的地区，可把七八月份降水量的1/3贮存于土壤中，可供翌春作物利用，春旱较轻。世界上干旱、半干旱地区旱害也是小麦生产发展的限制因素。因此，搞好农田基本建设，积蓄雨季降水，发展灌溉事业，是小麦高产的关键。

小麦生育后期即乳熟阶段，由于高温、低湿并伴随强风，而形成危害小麦正常灌浆的大气干旱，俗称“火风”。一般干热风害的指标是日最高气温≥30℃，14时的空气相对湿度≤30%，14时的风速≥3米/秒。各地因气候、土壤条件的不同，指标不完全一致。中国北方在5月至6月份常出现干热风天气，此时正值小麦乳熟期，气温高、湿度小、蒸发量大，小麦叶片含水量减少，根系活力降低，导致植株水分失调，细胞膜透性被破坏，光合作用受阻，往往短时间内就会成灾。受害植株茎秆和麦穗枯黄，颖壳发白，芒“炸开”，籽粒干瘪，千粒重下降，一般下降1～3克，严重时达5～6克。

苏联称为“干旱风”，在其欧洲部分的南部、东部和中亚细亚地区也经常发生。美国称为“干风”，主要发生在西部地区。中国的北方地区平均每10年有1～2次重干热风出现，重干热风年危害面积达1300万公顷以上，以华北平原、河西走廊、新疆等地受干热风危害较重。

采取改革种植制度，选用早熟品种，增施磷钾肥，灌浆时浇麦黄水以及营造防护林等措施，对减轻干热风危害都有一定效果。

一般分越冬期冻害与春季冻害。冬小麦越冬期间生长缓慢或基本停止生长，抗寒力较强，但即使是抗寒力强的冬性品种，如冬季极端最低温度降到－20℃以下也会遭受冻害；弱冬性品种一般在－16℃以下就会受害。另外，若播种过早，冬前生长过旺，或播种过晚而苗弱，或播种过浅分蘖节靠近地面时，都会使冻害加重。春季小麦返青后，特别是拔节以后，抗寒力下降。如果在拔节后1～7天内遇－9℃的低温、7～14天遇－6～－7℃的低温、14～20天遇－2～－3℃的低温、20天以后遇－1℃的低温，都会受冻，轻者降低结实率，重者死苗。这种冻害通常叫晚霜冻害。

苏联的欧洲部分，特别是乌克兰北部、伏尔加河中下游和北高加索，中国北方冬麦区的北部、新疆冬春麦区的北部，冬小麦越冬期常有冻害发生。华北平原较严重的冻害5～6年一遇，新疆北部4年一遇；有的年份死苗率达20%以上。1977年、1980年，中国大部分冬麦区气温较低，小麦不同程度遭受冻害。播期过晚，播种过浅或品种选用不当的地块，造成大面积死苗。甘肃省陇东地区1949年以来较严重的冻害有11次，累计毁种面积67万公顷。

在上述地区确定冬小麦合理的种植北界，选育适于当地气候的品种，适期播种，播种深度适宜，是防止冻害的重要途径。晚霜冻害在中国产麦区也有发生，尤以北方冬麦区及西南、西北高寒地区威胁较大，霜冻前采用灌水、镇压等栽培措施，能预防或减轻霜冻危害。

因雨水过多、地下水位高、土壤质地粘重而排水不良，使土壤水分较长时间处于饱和状态（田间持水量80%以上），造成土壤中缺氧；或因连绵阴雨，不仅土壤饱和，空气湿度也大，加上日照少，恶化了小麦生长发育的生态环境，都会使小麦遭受湿害。播种时，如土壤处于饱和状态，则无法进行播种作业。小麦苗期虽较耐湿，但若遇湿害，土壤中缺氧，幼苗的生理活动受抑，从而生长不良，严重时会烂根。拔节以后如遇湿害，将使根系早衰，茎叶早枯。小麦抽穗开花期的连续阴雨，有利于赤霉病、叶枯病等的发生和蔓延，危害更为严重。收获时降雨过多，还会引起穗发芽。

湿害是中国长江流域冬麦区和华南冬麦区的主要自然灾害之一，霉雨早临年份常造成危害。在3月至5月降雨量大于300毫米的地区，要采用开沟排水、深耕、增施有机肥料等措施防治湿害。3月至5月降水量大于400毫米的地区，不宜种麦。

中国西北、西南地区，小麦开花期间还会遇到低温冷害。即气温降至10℃以下，常引起花粉发育不良，甚至影响正常开花而不孕。靠近山区的麦地，小麦灌浆至成熟期间常有冰雹的危害。西北地区还有雪害和冰壳害，这些灾害多为局部地区发生，危害面积不大。