在有性生殖的群体中，每一个体与该群体中所有异性个体有相等交配机会的繁殖方式。在这类群体中任何一对雌雄个体间的结合都是随机的，不受任何选择因素的影响。在植物中，雌雄异株、自交不孕以及其它异花授粉植物类群，一般通过风力和昆虫传粉，没有明显的选择作用，可以认为是随机交配或近似随机交配的。有些异花授粉植物，如玉米等，有一定的自交率，除了自交后代之外，其余的子代可以看作是随机交配的产物。

随机交配的生物学意义在于保持群体遗传结构的相对稳定性。G.H.哈代（Hardy）和W.温伯格（Weinberg）1908年提出遗传平衡定律：在一个无限大的群体中，如果没有突变、迁移，也没有任何形式的选择，由于随机交配的进行，群体中各种基因型的比例可以保持世代不变。实际上遗传平衡定律所假定的理想条件是不存在的。因为没有无限大的群体，也没有绝对不受自然选择影响的基因。在自然界中只能有近似于这些条件的群体。在农业生产中更不存在这样的群体。但是在生产实践中，遗传平衡和随机交配的理论仍然具有指导意义。

根据遗传平衡定律，必须在相当大的群体内才能保持随机交配的进行。如果群体过小，就会发生遗传漂变，从而改变群体的遗传结构。例如由于引种、迁移、留种、分群、建系以及发生大规模的传染病等原因，都会因在过小的群体内交配而发生遗传漂变，从而导致种群基因型频率的改变，丧失其典型性和某些有益的经济性状。

在植物遗传和育种研究中，往往采用双列杂交的方式，使参加交配的所有亲本对交配的后代有同等的遗传贡献。这种交配方式可以看作是人为的随机交配。