方差分析中样本均方所估计的总体理论方差组成。简写为EMS。单向分组组内观察值数目相等的试验，其线性模型为X_ij＝μ＋а_i＋ε_ij，固定模型时，限制条件为∑а＝0，ε_ij～N（0，σ²），随机模型时，限制条件为α₁～N（0，），ε_ij～N（0，σ²）。其EMS见下表。

附表

该试验处理间均方为。固定模型时，估计了，其中，后面部分σ²/n为由样本平均数估算时的误差，这样，Ms_t估计了。同理，随机模型时，MS_t估计了。

两向分组单独观察值资料的线性模型为X_ij＝μ＋а_i＋β_j＋ε_ij，各MS所估计的EMS见下表。

两向分组重复观察值时，其线性模型为X_ijk＝μ＋а_i＋β_j＋（αβ）_ij＋ε_ijk，各MS所估计的EMS见下表。

附表

对期望均方组成的了解有助于确定变因显著性测验的比较对象。例如两向分组重复观察值资料中测验A因素的显著性时，第一、四种情况应将MS_A与MS。作比较；第二、三种情况则应与MS_AB作比较，即被测验均方的EMS与用作比较标准的均方的EMS，应该只差一项该试验因素效应的方差分量（参见方差分析和线性可加模型）。

附表

期望均方还可用以估计各变因的方差分量，从而对总体的变异作出评估。例如两向分组单独观察值资料，若A为基因型因素，B为区组因素，用随机模型时，则可估计出＝（MS_A-MS_e）/n。为基因型方差，由此可估计组内相关系数。h²＝/（＋σ²/n）＝（MS_A-MS_e）/MS_A，这在遗传育种上即为遗传力。