在繁殖马铃薯品种和优良品系的过程中，采取一定的程序和制度以及有效的技术措施。防止种薯感染病毒及真菌细菌病害，保持品种的纯度和典型性状，防止机械混杂和损伤，以合乎用种标准要求，不断地给生产提供优质良种。

国际上种薯生产和输出占优势的国家是荷兰与加拿大，他们均建立有健全的良种繁育体系。荷兰把种薯生产分为两种六级，即基础种（含S、SE、E三级）和合格种（含A、B、C三级）。基础种相当于中国的原原种和一、二级原种，用于生产合格种的种薯；合格种相当于中国的一、二、三级良种，用于生产商品薯。种薯生产的基本程序是S级→SE级→E级→A级→B级→C级。S级种薯的来源，一是切割茎尖进行组织培养，经检定确认生产出来的无病毒试管苗；二是经检定确认具有品种的典型性状的无病植株所产生的块茎。

中国采用的繁育体系是由原原种生产原种，再用原种逐级生产一级良种→二级良种→三级良种。一般多用三级良种供生产商品薯。原原种均由品种育成单位提供，由原种场繁殖原种供良种场和特约农户按程序繁殖一级、二级和三级良种。原原种的来源，一是采用无病毒试管苗，在无菌操作条件下切段置于三角瓶中加快繁殖，再移入严防蚜虫的纱网棚内栽植，收取其块茎供做原原种；二是采用株行圃进行无性系的连续选择生产原原种。第一年自原原种田中选优良单株2000～3000个单株块茎，于冬春在温室内种植，用血清和指示植物鉴定，决定选出无病单株收取块茎；第二年设株行圃，将第一年入选单株块茎播单行，每行5～6株，生育期间全部进行鉴定，按株行淘汰带病无性系，入选优异株行。第三年和第四年仍设单行圃，行长延长、株数增加，继续选优异株行，淘汰带病无性系。第五年将第四年入选的株系设小区繁殖，并进行产量与病害鉴定，决定选出最优小区的株系做为原种。这种措施在北方一作区称之为五年四圃制；在中原二作区、南方二作区和西南一、二季垂直分布区，因一年可播种两季，于三年内即可完成四圃制。

繁育种薯的基本措施有：①利用病毒抗血清和指示植物，以及凝胶电泳等方法，鉴定原原种和原种是否感染病毒，以及感染病毒的种类，并采用茎尖脱毒和茎切割加速繁殖无病试管苗做生产原原种的基础材料；②选择3～4区轮作地作为种薯繁育田，种薯繁育田还应与商品薯生产田保持100米以上的距离；③生产原原种和原种采用整薯播种，块茎直茎为2.8～3.5厘米，以防切刀传染病害；④根据有翅桃蚜迁飞测报早期割秧，实行早收留种；⑤良种田加大行距，保证茎叶在行间不接触摩擦，以防相互传染病毒病，如X病毒、纺锤块茎类病毒等均可摩擦感染。