原生生物界中的一个亚界，是一类以单细胞为主的真核生物。已知约6.5万种，其中一半是化石。现存种类中有1万种左右属寄生性。按现代分类系统，原生动物亚界分7个门。昆虫病原原生动物隶属于其4个门：肉足鞭毛门（Sarcomastigophora）：如变形虫、鞭毛虫。顶复合体门（Apicomplexa）：如簇虫、球虫。微孢子虫门（Microspora）：如微孢子虫（见图）。纤毛虫门（Ciliphora）：如纤毛虫。

斜纹夜蛾微孢子虫

原生动物侵染昆虫，多数经口或卵传播，少数经寄生蜂产卵器传播。进入寄主体腔后，在适合条件下感染昆虫肠壁细胞、脂肪体、马氏管和血淋巴等组织。原生动物可进行无性繁殖和有性繁殖。无性繁殖方式有：①二分裂和出芽，即一个母细胞分为两个新个体；②多体裂殖，即细胞核分裂多次，形成多核，然后整个细胞原生质进行分隔形成多个新个体。有性繁殖是经过减数分裂，同形或异形配子融合形成合子，合子再进行分裂。一般昆虫病原原生动物只有一种寄主，最适发育温度通常与昆虫寄主一致，35℃以上发育多受抑制。原生动物的孢子或孢囊在虫尸内或潮湿的土壤中可存活几个月。

在自然界中，某些昆虫病原原生动物是调节昆虫种群数量的重要因素，如微孢子虫、新簇虫等经常在自然界中引起昆虫大量死亡。尤其微孢子虫对玉米螟的自然感染率可达40～90%；多数昆虫至少受一种微孢子虫的感染，但由于作用缓慢，一般只作为综合治理中长期防治的措施之一。有些种类，如飞蝗微孢子虫（Nosema locustae）已作为微生物杀虫剂在美国注册生产。反之家蚕和蜜蜂的微粒子病却给养蚕和养蜂业带来重大损失。