兴建水库或蓄（滞）洪等水利工程带来淹没、浸没、塌岸等影响，所采取的有计划的妥善安排。水利工程淹没影响包括蓄水区、洪水回水、浸没塌岸和风浪影响等地带。通常有：农业和其他经济用地；城镇和农村居民点；工矿企业；铁路、公路和其他道路、桥涵、通讯和输电等设施；文物和古建筑；林木、矿藏、风景等自然资源。淹没处理的任务是根据工程规划和设计的淹没区，以及浸没、坍岸地段，实地调查自然条件，社会经济现状和发展计划；评估受影响对象的财产数量、质量和淹没损失；进行淹没处理规划设计，提出迁建或防护等处理方案和投资概（预）算。

淹没处理是关系水利工程建设速度的一个重要问题。淹没影响的大小和处理工作的难易，与淹没地带经济开发程度、人口密度和工程开发规模密切相关。世界各国对蓄水工程的淹没处理方式随国家政治经济和社会制度的不同而有差别。在生产资料私有制的国家里，一般由政府或事业主管单位管理赔偿事宜，支付给原土地或财产所有者一定的款项，任其决定去从，不负责其产业重建和生活安置。中国在社会主义制度下，水利工程淹没征地补偿、移民安置及其他国民经济部门的迁建处理都采取统一组织迁建的办法，并要求象对待主体工程一样，事先做好规划设计工作。淹没调查是进行淹没处理规划设计的基础工作。调查前，要做好技术准备，如备齐各项技术应用资料、测图和相应的调查工具、仪器，编制调查提纲，拟定调查表式和调查报告主要章节内容，向各经济部门提出委托调查任务书等。外业调查主要按高程控制平面范围，以行政区划为单元，逐村逐户调查受淹经济对象及实物数量。调查方法有测量定线、填图和典型调查。随着科学技术的发展，中国在淹没处理调查中已开始运用遥感新技术，为提高调查的效率和精度开辟了新途径。

制定淹没处理规划是水利工程淹没处理的关键。在中国，一般以移民迁建安置和淹没区城乡居民点的防护为其中心内容。主要包括城镇和农村移民安置规划；工业企业、交通道路、通讯和输电线路等经济设施的防护、迁建规划；森林、矿产等自然资源提前开采利用规划；文物保护、发掘和复建规划；水域及水库消落地区土地利用规划；水库库底清理规划；水源保护、卫生防疫、库岸绿化及水土保持规划等。这些规划的政策性较强，要根据《国家建设征用土地条例》和城乡建设有关法规，由政府部门主持，组织或委托专业规划设计机构负责完成。为确定淹没处理范围和移民征地界线，要合理选定洪水回水淹没标准，通常采用综合分析和统计两种方法。综合分析法就是根据工程建设目的、调节性能，运用方式，计算分析建库前后不同洪水流量过程，估算洪灾损失的增量以及采取工程措施可能减少的洪灾损失等情况，经综合分析比较后确定标准。统计法就是计算等于或大于某一洪水流量的多年平均损失与等于或小于同一洪水流量而得到的多年平均利益，经过分析对比，从而选定洪水回水淹没标准。洪水回水末端淹没影响的界线，取决于末端河谷形态和自然、经济现状条件，以及是否构成经济上、安全上的严重影响而定。具有防洪任务的水库以及蓄洪淹没区，则以设计蓄洪水位及其相应的回水淹没为移民界线。一般蓄洪淹没区，凡不影响土地的正常耕作利用，尽量不予征用。在淹没处理措施上，凡移民线以下的城乡居民点及各类生产、生活等固定经济设置，要拆除迁建，并进行移民安置规划。为了减少淹没损失和移民数量，在有条件的局部淹没区，可采取堤防、护岸等工程措施予以保护。在重点浸没、坍岸地段应设立监测站进行观测，并根据各项设计，采取防治措施。