通过控制贮藏条件以保持种子较高的生活力（或称生命力）与活力的措施。不适宜的贮藏条件（高温、高湿、高含水量）会引起种子很快丧失活力与生活力。因为在这种环境下种子自身代谢加强，贮藏物质大量消耗，种子老化加速，并且易受病菌侵害。种子和病菌强烈呼吸产生的热量会使种子堆温度上升，从而伤害甚至杀死种子。即使在理想的贮藏条件下，种子的老化过程也会缓慢地进行。

种子老化表现为细胞膜透性增加，导致种子可溶性内容物漏失，酶（特别是脱氢酶，谷氨酸脱羧酶）活力丧失，细胞核出现罕见的裂片，线粒体嵴膨胀，有的没有完整的外膜，呼吸的磷氧比（P/O）下降，游离脂肪酸增加，染色体断裂以及不规则的再连合造成染色体畸变。有不少的研究者将上述的生化劣变归因于类脂过氧化产生的氢过氧化物、羰基化合物对蛋白质和核酸结构的破坏。老化种子除了外表颜色改变以外，在萌发和生长上也受到不同程度的损害。重的丧失发芽力，轻的则活力下降，表现为萌发率下降，萌发条件变窄，生长异常，产生畸形苗，幼苗生长慢甚至停止生长。如老化洋葱种子萌发时不产生子叶节，从而影响破土出苗。老化南瓜种子萌发时，下胚轴生长受阻，种壳不能被顶开。这些矮化苗都不能存活。老化种子产生的幼苗会出现更多的突变表现型。另外，染色体畸变还会引起花粉的败育突变。

各类种子都有其自己安全贮藏的特殊要求。大部分水生植物，如菰属植物的种子在干燥条件下很快丧失生活力。只有在水中冰点以下才能很好保存。对于那些必须保留相当含水量才能维持最大生命力的非正规种子（忌干型种子），如榛属、栗属、栎、七叶树属、柳属、胡桃属的一些种以及野生稻、椰子、鳄梨、咖啡、可可、橡胶树的种子即使在潮湿条件下保存，它们的寿命常常也相当短，很少能超过几个月。对这类种子的贮藏研究较少，目前还没有好的贮藏办法。其余绝大多数种子是正规种子，能经受脱水干燥。这类种子长期安全贮藏最关键的条件是温度和相对湿度。种子收获后尽可能快地干燥到含水量低于14%，并保持此水平。最大贮藏寿命的理想含水量是5—6%。低于5—6%，由于类脂过氧化，劣变更快。油料种子，如芝麻、红花最好控制在4%含水量。5—29℃是满意的贮藏温度。对许多植物的种子最好贮藏在-18℃以下的温度。零下低温贮藏，高相对湿度会引起生活力丧失，除非将种子装入防潮容器内。J.F哈林顿提出种子含水量、贮藏温度与种子寿命相互联系的经验估计法则，来预测与贮藏条件有关的种子生活力丧失的情形。该法则的内容是：①贮藏温度（华氏，℉）与相对湿度算术和不超过100，温度不得超过总和的一半。②种子含水量（以鲜重为基础）每减少1%，贮藏寿命延长一倍（E.H.据罗伯兹对许多植物的计算结果，更确切地说是种子含水量每减少2%，贮藏寿命延长一倍）。③贮藏温度每下降10℉（5.6℃）种子贮藏寿命延长一倍。A.M.迈耶和A.波利乔可夫一梅伯认为种子含水量比贮藏温度更为重要。

有开放贮藏、隔湿贮藏及真空和气体贮藏。开放贮藏是将种子散装或用布袋包装，存放于仓库中。种子含水量完全受库中湿度、温度影响。开放贮藏最好结合0—5℃低温贮藏。隔湿贮藏是，将种子干燥到低含水量后装入隔湿包装材料中封存。这种贮藏对温度要求不甚严格，可以低温，也可以常温。夹有0.5—2μm铝箔的具迭层结构的聚酯或牛皮纸袋、夹有滤清的迭层结构的聚乙烯或牛皮纸袋以及锡罐，密封后都能获得满意的防潮效果。低水分含量的蔬菜、花卉和树木种子采用此法密封贮藏于-4℃下，20年后仍保持很高的发芽率。烟草种子则在25年后仍保持很高的发芽率。大豆在2—10℃下贮藏10年生活力没有降低。含水量低于13%的棉花种子密封防湿存于0—6℃，15年后没有发生劣变。含水4%的向日葵、芝麻种子在任何温度下封存二年后，萌发率与封存时一样。真空与气体贮藏是近年新开发的研究项目。F.W.温特将50种植物的种子真空贮藏10年后发现生活力没有改变。可是其它学者发现红三叶草种子真空或氮气贮藏寿命不如开放贮藏的长。甘蓝、洋葱种子20℃空气封存的比氮气贮藏的好。种子长期安全贮藏除与贮藏条件有关外，还与收获时种子成熟度、收获前天气情况、机械损伤及品种差异有关。