能导致胚胎中途夭折或幼畜出生后死亡的基因。导致此类基因产生的突变，称为致死突变。

致死基因按表现程度可分为全致死基因（纯合体全部死亡或90%以上死亡）、亚致死基因（纯合体死亡率50%～90%）、半致死基因（纯合体死亡率10%～50%）和弱致死基因（基本正常，纯合子死亡率在10%以下）。不导致家畜死亡，但降低生活力，影响健康的基因称为有害基因。致死基因突变可发生在任何染色体上，发生在常染色体上的称为常染色体致死基因，发生在性染色体上的称为伴性致死基因。致死基因有显隐性之分。

显性致死

致死基因呈显性遗传，因此，显性纯合子在胚胎早期，甚至在配子、合子期就可以致死。杂合子常表现出易识别的异常性状，杂合子自交，子二代出现2∶1的分离比。例如，有一种爬行鸡，由于胫骨、翅骨特别短，行走时像爬行。在爬行鸡与爬行鸡的杂交试验中，子代中爬行鸡775只，正常鸡388只，比数约为2∶1。当爬行鸡与正常鸡交配时，后代中爬行鸡1676只，正常鸡1661只，比数约为1∶1。这个结果表明，爬行性状是显性，正常性状为隐性，爬行鸡必然是杂合子，显性纯合子可能没有出壳。图解如下：

致死基因

随后的验证查明，CPCP个体在孵化第4天死亡，致死基因是通过杂合子传递的。

隐性致死

早在20世纪初已发现，黄色小鼠不能真实遗传，不论是黄鼠配黄鼠，还是黄鼠配黑鼠，子代均出现分离。分离比为：

黄鼠×黑鼠→黄鼠2378只，黑鼠2398只

黄鼠×黄鼠→黄鼠2386只，黑鼠1235只

从上面第一种交配方案看来，黄鼠很像是杂合子，因为黄鼠与黑鼠交配的结果，后代分离比为1∶1。但第二种交配方案，后代的分离比是2∶1而不是3∶1。后来发现，在黄鼠×黄鼠的子代中，每窝小鼠数大约比黄鼠×黑鼠时少1/4左右，这表明纯合体黄鼠在胚胎期已经死亡，因此上述交配结果可以表示为：

致死基因

这表明A^Y基因有多效性，它既是一个控制毛色的显性基因，又是一个影响生活力的隐性基因，A^Y基因纯合体的胚胞植入子宫壁后不久便死亡。

隐性致死基因一般在杂合状态下不影响个体发育和生活力，而显性致死基因在杂合状态下常影响发育，表现出异常状态，这是它们之间的主要区别。

伴性致死

存在于性染色体上的致死基因，不论是显性或隐性，都能使异配性别（XY、XO、ZW、ZO）个体死亡，出现性比不平衡。

基因种类

不同类型基因对机体的影响程度存在差异，致死基因的影响程度最强，半致死基因其次，有害基因一般不引起个体死亡，但能降低生活力。有害与有益具有相对性，如动物的无毛症通常是有害的，但在炎热地区，此种突变型更能适应当地条件。致死基因的作用时期也有很大差异，有的在配子期死亡，有的在合子期死亡，有的在胚胎期死亡，有的甚至在性成熟后显示效应，表现为延迟致死。

环境条件

环境对致死基因的效应有一定影响，按环境条件对致死效应的影响可分为条件致死和非条件致死。前者在某种条件下才出现致死效应，后者则在任何条件下均可致死。鸡的一种致死基因能引起胚胎在孵化14天前后死亡，原因在于核黄素合成障碍，使种蛋中核黄素含量仅及正常鸡蛋的1/10～1/8。试验证明，对种蛋注入核黄素，孵化时鸡胚可正常发育出雏，表明改变环境可影响致死效应。

近交与杂交

近亲繁殖使隐性致死基因纯合的概率增高。因此，致死基因的危害在近交时更为严重。杂交时由于杂合效应，可缓解致死基因危害。