蜂场常用的消毒药物主要有：甲醛（38%），配成4%的甲醛溶液或用甲醛蒸气来消毒被孢子虫、病毒和细菌污染的巢脾及蜂箱；0.1%～0.2%过氧乙酸溶液消毒被细菌、病毒和真菌污染的巢脾和蜂箱；高效巢脾消毒剂消毒被细菌和病毒污染的巢脾和蜂箱；二硫化碳熏蒸可杀灭蜡螟的卵、幼虫、蛹和成虫；硫磺燃烧产生的二氧化硫可用来杀灭蜂螨、蜡螟、巢虫和真菌。2%的烧碱溶液可用来洗刷被美洲幼虫腐臭病和囊状幼虫病污染的蜂箱和巢框；2%～5%的苏打水溶液可用来消毒小型蜂具、盖布及工作服等；10%～20%的石灰乳可用来消毒蜂场及越冬室。