杂交水稻生长势旺盛，营养优势强。同常规稻相比，杂交水稻表现为种子发芽快，分蘖力强；根系发达、分布广、扎根深、吸肥力强。杂交水稻在植株高度上普遍具有明显的杂种优势，但杂交水稻茎粗壁厚及矮秆基因的引入，在抗倒性上仍然表现出较强的杂种优势。杂交水稻单株绿叶多、叶片厚、冠层叶面积大，这为制造较多的光合产物提供了条件。杂种一代繁育力强，生殖优势明显。具体表现为穗大粒多、产量高及生育期延迟。70年代杂交水稻比矮秆水稻品种增产11.2%～32.1%，主要是每穗粒数增加了18%～30.7%，千粒重也增加了9.2%～12.0%。

由于杂种穗大粒多库容量大，往往灌浆期较长，导致杂种全生育期比亲本延迟。由于杂种在生长势等方面表现出优势，使得抵抗外界不利环境条件和适应环境条件的能力往往比亲本强。水稻杂种一代在抗倒、抗旱、耐低温、耐瘠薄等方面都具有明显优势。在抗旱性方面，杂种优势尤为突出，大部分杂交稻组合均可作为旱种品种种植，如黎优57、辽优5218、屉优418等组合，在京、津、鲁、豫等地做麦茬稻旱直播均表现出极强的抗旱优势；在抗寒性方面，杂交种的苗期耐寒性与母本不育系的相关性显著，而且表现出超亲优势；在抗稻瘟病和抗白叶枯病方面，杂交种一般均表现显性抗性优势。