原原种是育种单位选育出的品种，通过国家或省级审定以后，为种子生产单位提供的繁殖原种用的种子。它由育种单位直接生产和提供。原原种的纯度应在99.8%以上。

原种则是由原原种繁殖而来的、用来扩繁良种即生产用种的种子。原种的纯度应不低于99.8%。

良种是由原种扩繁而来的种子。良种直接应用于生产田。

三者的区别主要是生产的产权和纯度不同。