水稻品种是人类在生产实践中采用一定的育种手段，经过选择、培育和繁殖而成的、个体生物学特征和性状整齐一致的栽培群体。品种是育种过程的终极产品，是具有合法“身份”的“品系”。同一群体内的不同植株具有相同的基因型。

水稻品系是在水稻育种工作中，采用一定的育种手段育成的性状基本整齐、稳定，表现优良而尚待生产鉴定的水稻群体。品系的生产利用价值尚未肯定，一般不正式命名，可用编号表示。

品种与品系的主要区别是：品种已通过国家或省级区试和生产试验鉴定，得到正式审定命名并允许在适宜地区大面积推广；品系则没有或正在参加国家或省级区试和生产试验鉴定，但还没有正式审定命名，允许小面积试验示范，不允许大面积推广。