循环农业发展同样要遵循循环经济的“3R”原则，即减量化原则（Reduce）、再利用原则（Reuse）、再循环原则（Recycle）。其目的是真正实现农业生产源头预防和全过程治理，其核心是农业自然资源的节约、循环利用，最大限度发挥农业生态系统功能，推进农业经济活动最优化。一是减量化，实现“九节一减”，即节地、节水、节种、节肥、节药、节电、节柴（节煤）、节油、节粮、减人，最大限度地节省农业投入成本。二是再利用，对各类农产品、土特产品、林产品、水产品及其初加工后的副产品及有机废弃物进行系列开发、反复加工、深度加工，不断增值。三是再循环，将农村中的农业废弃物（秸秆）、规模养殖中的畜禽粪便、生活垃圾等，化害为利，变废为宝，再回到农业生态系统中去。现在农村最可行、最常用的措施是把这些转化为沼气，为农村提供清洁能源，制作有机肥料。