不同类型生物农药的生产方式不同，概括起来有以下几种：

（1）发酵

真菌类、细菌类的生物农药和抗生素类的生物农药都是以人工配制的培养基通过液体或固体发酵生产出来的。细菌或真菌在培养基上大量繁殖后，经过提取、分离和浓缩，得到需要的菌体或者其产生的活性物质，再经过剂型加工，就可以得到我们需要的生物农药了。

（2）活体繁殖

有些微生物、原生生物、线虫等，如昆虫病毒、微孢子虫等，很难找到合适的人工培养基，就只能人工大量饲养某种昆虫，然后让病毒或微孢子虫在昆虫体内繁殖，再经过提取分离和加工，生产出能够在田间使用的剂型。

（3）采集和提取

绝大多数的植物源农药都是直接采集植物的某些部位。例如苦参的根、除虫菊的花、印楝的果实，经粉碎、提取、分离、浓缩和加工形成产品。

（4）人工合成

少数已知化学结构，而且化学结构比较简单的生物农药。如某些昆虫信息素，通过人工合成有效成分，然后再根据天然信息素中各有效成分的比例进行混合，生产出和天然信息素相同的产品。

和化学农药相比，生物农药的有效成分对外界不良环境条件的抗御能力差，本身又容易分解、失活，所以在进行剂型加工时的要求就较高，所使用的助剂不能对有效成分产生毒杀和抑制作用，而且还要对其起到保护作用，延缓其分解和失活的速度，以尽可能地延长其有效期。