有性繁殖即实生繁殖，就是利用果树自身果实的种子直接播种所进行的繁殖，又称种子繁殖。用这种方法繁殖的苗木，叫实生苗。实生苗的繁殖方法简单，种子来源充足，便于大量繁殖。实生苗根系发达，生长健壮，对外界环境的适应能力强。

果树的病毒病，主要是通过嫁接传播，而不是通过实生播种，即实生繁殖不会传播病毒，所以在隔离条件下所育成的实生苗并不带有病毒。因此，利用实生苗优良单株的枝条作为繁殖材料培育苗木，是防止果树病毒病的有效途径。

但是，实生苗的后代容易发生变异，特别是异花授粉的树种，如苹果、梨等，原有的优良经济性状往往不能保存。因此，有些果树的实生苗不能直接用于生产，而是用作嫁接繁殖的砧木，如山定子、海棠、杜梨、山桃、山杏等。采用嫁接繁殖，可保持品种的优良形状和生长的一致性。

在苹果属果树中，也有无配子生殖或无融合生殖，如变叶海棠和锡金海棠，在自花授粉条件下能形成无配子生殖体，在异花授粉条件下大部分产生杂交种子。如用无配子生殖种子繁殖出的实生苗，既不感染病毒病，其性状和生长整齐度也很一致，可直接用于建园。

虽然在果树实生苗的变异中，劣变的比例很大，但也有极少数的优良变异，所以在常规杂交育种工作中，还是采用播种繁殖，以从中选出优良品种。