世界报道30多种，至1990年，中国已发现侵染性病害10余种。为害根的有红根病（Ganoderma lucidum），线虫病（Rotylenchulus reniformis）等。为害茎干的有泻血病等。主要为害叶的有炭疽病（Glomerella cingula-ta）、叶枯病（Pestalotiopsis palmarum），褐斑病（Plenodomus cocogena）等。为害芽的有芽腐病。为害全株的有白线疫病（Corticium penicillatum）。以芽腐病、泻血病为害较大。致死性黄化病、败生病和根萎蔫病为害最大，被称为“椰子三大病害”，红环腐病是中南美洲特有的线虫病，上述四种病害为中国热带作物病害的外检对象。

主要分布于拉丁美洲、古巴及美国佛罗里达州，是加勒比海地区的毁灭性病害，使青果脱落，佛焰苞花序轴顶端变黑坏死，以后叶片开始黄化，迅速发展到所有叶片，直至脱落，并能导致芽腐，心叶容易剥离，根系逐渐死亡。植株从发病至死亡一般只需3月至6个月。病原物是类原菌体（MLO）。菌体大小400～2000纳米，传病昆虫介体为叶蝉（Mynduscrudus），寄主范围包括椰子等30多种棕榈科植物。西非与美洲的致死性黄化病有两个重大区别：一是“马来西亚矮种椰子”在西非属高感，而在美洲为高抗，二是在非洲为土传病害，而在美洲被认为是气传。病害控制：美国采用选种较抗病的马来西亚矮生品种；轻病树注射四环素或酸氧四环素，重病树挖除烧毁；严格执行植物检疫，禁止从病区引种。

又称黄色斑驳衰退病，菲律宾吕宋岛南部1926年最早发生，具毁灭性，已摧毁1200万株以上椰树。病株叶片有橄榄色病斑，直径12～50毫米，通常幼树不感病，病树经5～15年死亡，属慢死型病害。病原物ccRNA-1，ccRNA-2为类病毒，70年代末才确定，采取严格检疫，禁止从病区引种来控制。

是印度南部的一种致死性病害，1882年发现，至1969年已在25万公顷椰园发生，每年损失约3.4亿个椰果。最明显的症状是外轮叶片普遍黄化并枯萎，小叶松软。病因未明，1988年电镜检查发现病组织内存在类菌原体。病害控制：严格检疫，禁止从病区引种，选育抗病品种，清除病株等。

是中南美洲特有病害，病树最老叶片先变黄，不久小叶叶尖变褐枯萎脱落，最终内层叶片变色，若在将病死的椰树茎干齐腰高处横切，距离茎干外表皮3～5厘米的维管束处有一圈宽3～4厘米的橙红色环腐带，病原线虫多集中在此。红环腐带可从茎干向上延伸数米高，再往上便分裂成红色纵向条纹进入叶柄。根系也可被侵染，变色根系组织内有大量幼龄线虫。病原物为椰树细杆滑刃线虫，属垫刃目。雌雄虫均蠕虫状，虫体特别细长。传播介体主要为棕榈象（Rhynchoporus palmarum），其次为蜘蛛、鸟类、老鼠。寄主范围有椰子、可可、油棕、枣椰等。病害控制：严格检疫，禁止从病区引进该病原线虫的寄主植物；叶脉喷施涕灭威等杀线虫剂；选种抗病的马来矮×西非高种椰子杂交种；用异狄氏剂防治棕榈象。

又称疫病，最幼嫩的叶片开展后凋萎变褐，逐渐第二轮较嫩叶片凋萎变褐，中央叶蓬很易拔出，最终导致芽腐。病原物为棕榈疫霉（Phytophthora cactorum）。属卵菌，霜霉目。高温高湿有利发病，矮种椰子比高种椰子感病。病害控制：采取伐倒病株，烧毁病残体，病株周围未发病顶部喷施波尔多液或乙磷铝、瑞毒霉、杀毒矾等保护。

中国分布于海南，从椰树树干基部裂缝处流出铁锈色粘稠液汁，后变黑色，裂缝处组织腐烂。病原物为奇异长喙壳（Ceratocystis paradoxa），属子囊菌，球壳目，常见的是无性态奇异根串珠霉（Thielaviopsis paradoxa），属半知菌、丝孢目。病害控制：彻底挖除病组织并烧毁；在病部涂波尔多浆保护；加强病树施肥管理；防止人畜伤及椰树茎干。