至1919年中国已报道近20种。重要的有霜疫病、毛氈病、炭疽病和贮藏期病害。

1934年中国最早报道于台湾省，大陆50年代初记载，现以广东、福建的老产区病重。荔枝花、幼果、熟果、果柄、果枝均被害，高湿时还为害嫩叶，病叶局部褪绿、病枝局部变褐，病花和幼果早落，熟果上病斑不规则，无边缘，红褐色，最终果肉发酸，腐烂淌水，潮湿时病部生白霉层，即病菌子实体。病原物为荔枝霜疫霉[Peronophythora litchii Chen ex ko et al.]，属卵菌，霜霉目。无性态像霜霉菌，孢囊梗多级有限生长，有性态像疫霉，同宗配合，田间或培养基上均可形成卵孢子。生长最高温度30℃，22～25℃时产孢子囊量最高，11～30℃均能形成孢子囊。孢子囊在8～22℃形成游动孢子，14℃时形成游动孢子只需20分钟，以8～16℃时的萌发率最高，26～30℃时则形成芽管。侵染过程的各个时期都要求高湿度方能危害，高湿条件下，11～30℃可侵染荔果，25℃时潜育期不到1天，11℃时潜育期延长至7天，故缺乏抗病品种，荔枝开花结果期间多连雨天，病原物侵染频繁等是田间病害流行的主要原因。若采收期天气晴朗，运输途中湿度大，荔果在上市后大量霉烂。病原物在田间除荔枝外还为害番木瓜幼苗。主要以卵孢子在土壤内越冬，翌春成为初侵染源，贮运期间的菌源来自田间的病果。病害控制应以药剂防治为主，开花前喷施瑞毒霉、杀毒矾或乙磷铝；利用避病品种明显减轻发病；避免偏施氮肥。

主要分布于广东、广西、海南等省、自治区。树龄20年以上的大树被害率甚高，有时达70%以上，开花期间天气干旱诱发瘿螨大发生，使花穗干枯。叶被害时，产生不正形病斑，正面鼓起，背面内凹，密披锈褐色绒毛状物，绒毛间有许多瘿螨，经过数月，病斑部分干枯，绒毛有时成片脱落；嫩枝被害时，梢畸形；花穗被害，花器呈锈褐色，花萼膨大呈倒钟形，亦披绒毛状物，常全穗畸形干缩；果被害时，形小，味酸，病斑不正形，稍凸出，如一果上多个病斑，颇似病毒病症状。病原物为荔枝瘿螨，是螨类动物，属蜱螨目。成螨浅红色或乳白色，体躯有向前方生的足两对；卵近圆形，无色透明，表面光滑。树龄大而树冠稠密的果树被害重，阳光不能直接照射到的嫩叶发生多。多数成螨及若螨在叶背面的绒毛状物间越冬，或在花芽、叶芽上越冬，翌春二、三月，气温上升至18～20℃以上时开始活动，部份若螨迁移到花穗，叶芽或嫩叶上取食和繁殖，并不断扩散，通常八、九月抽出的新叶受害最严重。气流、微风传播，高接苗可长距离传播。控制应清除销毁苗木上的病叶，用高空压条法培育新苗，摘除病叶，以防传播；早春开花期喷布石硫合剂、三氯杀螨砜、三氯杀螨醇或各种杀螨剂。

分布于广东、广西、海南、福建等省、自治区。中国1985年首次报道为害荔枝果实，在霜疫病受到控制而减少的果园，炭疽病逐年增多。叶上形成近圆形或不正形的褐斑，或在叶尖、叶缘形成褐色、灰褐色大型斑块；枝梢回枯，花和幼果脱落，壮果上病斑近圆形，红褐色，边缘色深，有轮纹，但不下陷，生橙红粘质粒（病菌粘分生孢子团）。病原物是围小丛壳，属子囊菌，球壳目。无性态为胶孢炭疽菌，属半知菌，黑盘孢目。（见仁果炭疽病）。病害控制：加强栽培管理，切勿偏施氮肥；开花期结合防治霜疫病，喷布瑞毒霉加多菌灵混合液。

最主要是果皮褐变病、霜疫病和酸腐病。果皮褐变病是生理病，系随着荔果成熟，果皮内乙烯含量不断上升所致。低温贮藏可使乙烯产生和呼吸作用均受到强烈抑制，采用薄膜袋密封低温（3～5℃）贮藏较成功。霜疫病为害贮藏中的荔枝，主要是因为田间病菌侵染较晚，或因采前天气晴朗、湿度小，病果尚未发病而误作健果混入贮藏的，采后贮运中湿度大增，很快发病，并通过接触再侵染。药剂防腐效果较好，但各国政府尚未批准瑞毒霉等药剂用于产后防腐处理。故控制贮藏中烂果，关键在加强田间病害控制，结合采后预冷、低温贮藏等一系列处理。酸腐病一般发生于成熟果或裂果。控制霜疫病后酸腐病有增多趋势。病果病斑不定形，初水渍状，淡褐色，上生白霉，二三日使荔果变质发酸腐烂，后期淌水。病原物为地霉双足囊菌，属子囊菌，内孢霉目（见柑橘病害）。田间可零星发生、贮藏期间继续再侵染。目前尚无有效控制措施。

其他常见的病害见表。

荔枝其他常见病害