由原核细胞构成的生物。原核细胞和真核细胞是生物界表现得最突出的、没有发现过渡形式的形态特征。现有的知识表明，所有原核生物种类都是同源的；但由于知识不足，现在还未能编制出原核生物的进化图式。

绝大多数原核生物种类是单细胞生物。原核生物的大小悬殊，枝原体的体积只有0.01～0.10μm³；最大的单细胞光合细菌可大到5000μm³，原核生物比单细胞真核微生物的平均大小小得多，例如：

原核生物

原核生物包括通常意义上的“细菌”和“蓝绿藻”。由于科学发展的实际经历和科学研究者们的分工，蓝绿藻一向是藻类学家的研究对象，细菌是微生物学家的研究对象。只是随着细胞的超微结构研究的深入，才发现细菌和蓝绿藻都是原核生物，在生物界中同属于原核生物界，总称为细菌。从而将蓝绿藻改名为蓝细菌。1968年，默里（E.G.E.Murray）将原核生物界命名为Procaryotae。1978年，吉本斯（N.E.Gibbons）和默里将原核生物界分为四大群，随后默里又在《伯杰系统细菌学》中，做了部分修改：

原核生物界（Prokaryotae）

薄壁细菌类（Gracilicutes）包括为细胞壁有内壁和外膜两层构造（见细菌细胞壁）革兰染色阴性的细菌，分为三纲：

第一纲

暗细菌纲（Scotobacteria）化能营养细菌，包括化能矿质营养的硝化细菌和硫化细菌，化能有机营养的假单胞菌、醋酸杆菌、根瘤菌、固氮菌、钢螺菌、肠杆菌、拟杆菌、粘细菌、噬纤维菌、螺旋体等等，所属科目的种类。

第二纲

厌氧光合细菌纲（Anoxyphotobacteria）含叶绿素能进行光合作用，光合作用不产氧气，厌气性（见光合细菌）。

第三纲

产氧光合细菌纲（Oxyphotobacteria）含叶绿素，能进行光合作用，光合作用分解水产氧气，好气性，包括只含叶绿素a的蓝细菌（蓝藻）类和含叶绿素a和b的原绿菌（原绿藻）。

厚壁细菌类（Firmacutes）包括细胞壁只有一层厚壁、革兰染色阳性的细菌种类，它们都是化能有机营养的。分为两纲。

第一纲

厚壁细菌纲（Firmabacteria）包括各类单细胞的革兰阳性细菌。

第二纲

分枝细菌纲（Thallobacteria）包括各种放线菌和有关的细菌种类。

软膜细菌类（Tenericutes）只有柔膜体纲（Mollicutis）一纲，无细胞壁，细胞膜裸露，枝原体属于这一类。

疵壁细菌类（Mendosicutes）只有古细菌纲（Archaeobacteria）一纲，细胞壁膜类脂核糖体和RNA-碱基顺序等与其他细菌有很大的区别，它们生活在多种极端环境中，如产甲烷细菌只生活在高度还原的条件中。卤细菌只生活在含高浓度氯化钠（12%以上）的环境中，硫化叶菌只在高温环境中生活，最低55℃，最适75℃，最高可达85℃。