通过对种质材料主要器官的形状、大小、数量、色泽及附生物等主要外部形态特征的比较分析，确定其植物学分类地位和材料间亲缘关系的一种研究手段。

形态性状鉴定的主要内容和方法包括形态特征的描述、生态特征的观察比较以及形状指数的计算和分析：①植物学形态特征的描述。在蔬菜种质材料各生育阶段，主要是产品商品成熟及食用成熟的采收盛期和有性生殖生长盛期（开花结实盛期），选择有代表性的植株，对各器官（主要是达食用成熟的产品器官和有性生殖器官——花和果实）的基本形态特征作出描述，并参照植物学形态的描述标准和术语进行记载，包括必要的度量记载。②生态型形态特征的比较观察。对蔬菜种质材料由于一定的生态条件所形成的特征作观察记载，可补充植物学形态描述的不足。如大白菜叶球球顶的形态特点有闭心、半闭心、舒心、翻心、花心之分；叶球球叶的抱合形式有叠抱、摺抱、拧抱、合抱之分。这些生态型特征的差异是类型区分的重要依据。③形状指数的计算分析，对具有规律性形态变化的器官用“高度（长度）/横径（宽度）”公式计算出“形状指数”。如大白菜的叶形指数，结球甘蓝及大白菜叶球的球形指数，番茄果实的果形指数等，可进一步充实上述两项形态的描述。

鉴定记载项目：形态性状鉴定记载项目因蔬菜种类、食用器官及利用目的不同而异（以萝卜、大白菜、番茄为例）。

萝卜（根菜类蔬菜）的主要鉴定记载项目：

叶——叶簇组成叶数及生长状态、叶型，最大叶的叶片长、宽，叶柄长、叶片形状及形状指数、叶脉色泽、叶柄及柄基部色泽，叶缘、叶面附生物。

肉质根——根膨大部分长粗及其根颈部入土部分长度与肉质根全长的比率、根颈部的出土部分长度与肉质根全长的比率，单根重、形状及形状指数、皮色、肉色，侧根多少；子叶展开期幼苗胚轴颜色。

花——盛花期花朵大小，花冠颜色；雄性不育花大小，花冠颜色，雄蕊生长发育状况及与正常花的比较。

果荚——大小，每荚种子粒数，种子颜色及千粒重。

大白菜（白菜类蔬菜）的主要鉴定记载项目：

植株——株高、开展度，除去根重的单株重量。

根——主根粗度。

外叶——最大叶片长、叶片宽，叶片形状及形状指数，叶片色泽，叶柄及中肋长，叶柄基部、中部的宽及厚度、叶柄及中肋色泽；叶缘、叶片正、背面附生物的有无、种类、大小、多少、色泽，叶面组织生长情况。

叶球——形状及球形指数，球顶形状，抱合方式，紧实度，色泽，叶球重量，净菜率，叶球内短缩茎形状、短缩茎长度与球高度的比率，短缩茎侧芽萌发情况。

花——盛花期花朵大小，花冠颜色；雄性不育花大小及花冠颜色，雄蕊生长发育状况及与正常花的比较。

果荚——大小，每荚种子粒数，种子颜色及千粒重。

番茄（茄果类蔬菜）的主要鉴定记载项目：

植株——生长类型，生长习性，株高，开展度。

茎——茎粗，节间长度。

叶——叶型，叶色，叶面附生物。

花——花序类型，第一花序节位，花序间间隔叶数，花形及大小，花瓣数，花瓣色，开花直径，雌蕊柱头与雄蕊花药高度的比较。

果实——果形及果形指数、绿熟及红熟果颜色，果实大小、单果重，果面特征（有无棱沟），果脐大小，有无深色果肩及肩部裂痕（纵裂、横裂），横剖面心室数，果皮厚薄，果肉厚度，果肉颜色，种子周围胶状物颜色，单果种子数量，种子千粒重。