新建、改建、扩建或恢复水利工程设施所获得的净收益，是反映水利工程效果的一个重要指标。水利工程特别是大中型水利工程带来的影响往往是多方面的，其有利的方面称效益，其不利的方面称负效益。两者抵销后的收益称净收益。

水利工程的效益主要有：①经济效益。指通过修建水利工程设施，减少或防止水旱灾害，发展农业生产；提供生活和工业生产用水，满足城乡人民生活和工业生产需要；开发水力资源，提供廉价电力；改善航运条件，促进水运事业的发展，利用水域，发展水产养殖等，给国民经济各部门带来的经济收益。②环境效益。指由于控制洪涝水，调节河川径流，改善气候和土壤的水盐状况，创造更适于生活和生产的环境条件等，在改善生态环境所起的作用。③社会效益。指因工程兴建在增加就业机会，提高人民生活水平，促进地区发展等方面作出的贡献。

水利工程的负效益主要有：①经济损失。由于建设水利工程，使受影响区内铁路、公路、电力、电讯和工矿企业因停业、停产而减少的经济收入，以及由于某些不良影响，造成农业减产损失等。②资源损失。由于兴建水利工程使部分土地、矿藏、森林等资源不能开发利用而造成的损失。③社会影响。由于水利建设，对局部地区的社会状况带来的某些不良影响。④环境影响。由于水利工程改变某些水域或地区的环境而带来的某些不良影响。

兴建水利工程，要努力争取得到尽可能大的效益和好的效果，把不利影响减少到最小的限度，必要时应采用补救措施。

决定于水利工程本身固有的特性，主要有：①随机性。和水文现象一样，水利工程各年的效益往往很不相同。如某些年份发生的洪涝水接近于设计治理标准时，防洪、治涝效益较大，相反则较小；又如遇多雨年，农田需补充的水量少，灌溉效益相对较小，而干旱年，农田需补充的水量多，则灌溉效益较大。②可变性。水利工程在运行的不同时期，其效益是不相同的。如农田灌溉工程，建成初期，由于配套跟不上，或农业生产技术和经验缺乏，灌溉效益往往较小，随着配套面积扩大，生产经验增多，灌溉效益将逐渐增大。防洪工程在运行初期由于防护区内人民生活水平和经济发展水平较低，防洪效益相应低些，随着经济发展和人民生活水平的提高，防洪效益将相对增大。对施工期较长的水利工程，随着工程逐步建设和完善，效能逐步提高，工程的效益亦相应地逐步增长。有些水利工程，由于各种原因，功能逐渐降低，效益也相应逐年减少，如水库工程，由于泥沙淤积，库容逐渐减少，控制洪水和调节径流的能力逐渐降低。③复杂性。许多水利工程都具有多种功能，但各部门之间的效益常互有影响。例如一个水库，如要求加大防洪库容，增加了防洪效益，则势必减少兴利库容，使供水和发电效益相应降低。一项水利工程的兴建，给上下游、左右岸带来的效益和影响也很复杂，如在河流上兴建水库，将使库区受到淹没、浸没损失，但可给水库下游带来一定效益；又如上游一些地区从水库引水，可给地区经济发展带来好处，但引水量过多，则要影响下游原有用户的效益。

由于以上特点，为能较全面、确切地反映水利工程的效益，在分析计算时，常要计算不同水文年型的效益，也要计算多年平均效益；既要计及某一水平年的效益，也要计及随时间推移的过程；既要估算本工程的直接效益，也要估算工程给各方面带来的间接影响。

水利工程的效益，需要采用一些定量指标表示。常见的有：①水利技术效益指标。用水利工程的效能表示的效益指标，如调蓄的洪水量，削减的洪峰流量，提高的防洪、治涝标准和灌溉、发电的保证率，扩大和改善的灌溉面积，排涝、排渍和治理的盐碱地面积，改善和延长的航运里程，增加的养殖水生生物的水面面积等。②实物效益指标。用具有使用价值的实物量表示的效益指标，如提供的水量，增产的粮食、经济作物、水产品的产量，新增装机容量和发电量，增加的客货运量等。③货币效益指标。用货币表示的效益指标，如减免的洪涝灾害损失，增加的灌溉毛收入或纯收入，售水、售电收入，以及航运与水产养殖收益等。从不同角度分析的货币效益指标是不同的。经济分析中的工程效益称为经济效益，原则上应按理论价格计算；财务分析中的工程效益为财务效益，应按国家现行价格计算。以上三类效益指标，用不同方式反映了水利工程的效益，其中①、②两类指标比较形象直观。第③类指标经济概念具体，是反映水利工程经济效益和进行经济分析评价所依据的经济指标。

根据水利工程效能、所掌握的资料和经济计算的要求，可从以下途径，分析计算水利工程的效益：①增加的收益。以水利工程兴建后增加的实物、经济指标，作为该项工程的效益。②减免的损失。以水利工程兴建后减免水、旱灾害损失，减少工矿、企业停产、减产损失，作为该项工程的效益。③替代的支出费用。以水利工程等效替代其它工程或措施可节省的支出费用，作为该项工程的效益，如建水电站替代火电站，可减少的火电站的投资和运行费用，以水运代替陆运可减少的公路、铁路投资和运行费用等。

防洪、治涝工程效益 一般用减免洪涝灾害的损失计算。洪涝灾害的主要损失为：①淹没、冲毁、淤压的农、林、牧、渔等各类用地的损失；②居民住房和财产损失；③国家、集体各类设施和物资损失；④工矿停产、交通中断、商业停业等损失；⑤修复水毁工程、恢复工农业生产和交通等的费用；⑥防汛、抢险和其它费用等。由于技术经济条件的限制，各地的防洪、治涝标准有一定的合理限度，遇到超过设计标准的洪、涝情时，工程防护区的洪涝灾害仍不能完全免除，因此，一般情况下，应分别计算有无防洪、治涝工程时遇到不同等级洪、涝水的损失，并按出现的机率加权或绘制损失频率曲线，分别计算其多年平均的洪涝灾害损失，以两者的差额作为该工程的多年平均效益。洪、涝灾害的某些损失如人民伤亡和可能引起的其它社会问题等损失，很难用货币指标表示，可辅以文字阐述。防洪、治涝等水利工程属于公益事业，由于本身一般都没有财务收入，故一般只计算其经济效益，不计算财务效益。

灌溉工程效益 灌溉工程的作用在于提供水量，以补充天然降水的不足，减免干旱缺水造成农、林、牧等的损失。灌溉工程的经济效益，采用由于灌溉增加的多年平均农业（包括林、牧、副等）净产值表示。一般可根据该地区或类似地区，在其它农业技术措施基本相同的条件下，有无灌溉措施的对比试验或调查资料分析计算。农业增产往往是各种农业技术措施综合作用的结果，灌溉只是其中的一种措施，如果掌握的农业增产资料是综合农业技术措施的增产效益时，应根据灌区的具体情况，分析灌溉措施在综合增产效益中作用的大小，确定合理的分摊比例，用于计算灌溉后的农业增产效益，有时也可将综合措施的增产效益扣除灌溉措施以外其它措施的费用后作为灌溉措施的效益。灌溉工程的财务效益，可根据提供的水量和水价计算。中国和许多国家现阶段规定的灌溉用水价格，一般都低于工程供水成本，据以计算的财务效益往往较低。

水电工程效益 水电工程的经济效益是指该工程提供电力的价值，一般可用发电量的价值也可用节省等效替代工程的年支出费用（包括工程投资的折算年值和年运行费两部分）表示。如替代工程为以煤为燃料的火电时，还应包括煤矿和运输工程以及防治污染等有关的投资费用。其它类型的替代电站按同样原则计算。水电工程的财务效益，一般通过售电量（包括有功和无功）和规定电价计算。

供水工程效益 供水工程一般是指供给城乡居民生活用水和工矿企业生产用水。居民生活用水，包括日常生活用水和郊区菜田、副食基地和其它基本生活必需的用水，在水资源分配时，这部分用水是必需首先供应的。供给居民生活的经济效益一般采用节省替代工程的年支出费用或挤占其它部门用水造成的损失估算。各行业的工矿企业生产用水定额往往相差很大，由于缺水造成的损失也很不相同，一般情况下供给生产用水的经济效益应分行业甚至按工矿企业逐一分析计算，除可采用上述两种方法外，还可采用因供水获得的收益乘供水应分摊的比例系数计算，也可认为供水工程与用水部门具有同样的投资报酬率，根据供水工程投资乘供水地区的平均报酬率计算。供水工程的财务效益，可根据不同用户的用水量和供水水价计算。

水土保持工程效益 其经济效益主要是：①防治土壤侵蚀，保持水土，减少水、肥、土的流失，提高土地农、林、牧等的生产能力而增加的经济收入；②减轻山洪、泥石流的灾害，减少沙石淤压毁坏耕地，避免土壤侵蚀和泥石流对道路、桥梁、房舍和经济设施的破坏；③减轻沙石对河道、水库和其它水利工程设施的危害，减少涵洞、渠道等的清淤费用；④改善和维护生态环境等。其中①的经济效益，一般可根据治理和不进行治理的对比试验或调查资料分析计算，②、③可根据典型区的调查资料分析估计，④难预定量，但具有深远意义。水土保持一般也属于公共事业性质，可不计算财务效益。

航运工程效益 其经济效益一般按节省的替代铁路、公路等运输工程设施的年支出费用或节省客货运量的运费计算。其财务效益按每年营运和其它财务收入计算。

水产效益 可根据增加的水产品和其价值计算。

旅游效益 可根据水利工程提供的旅游活动数量和质量，考虑到交通、环境等条件，分析单位旅游日的价值，并根据每年可能的旅游量估算。