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全书共分十章。
其中，第一至第三章是农业土壤环境与农产品安全的统论性内容，重点介绍了农业土壤环境与农产品安全研究所采用的理论、方法，以及在国内外的研究进展、特点及重点；第四至第九章是结合浙江省“农业地质环境与农产品安全性研究”重大专项工作成果，介绍了上述农业土壤环境与农产品安全的理论方法、评价手段、信息化技术等的实例应用；第十章是从管理政策层面探讨如何加强农产品安全保障体系，特别是在战略措施、技术对策等方面给出了若干建议。
同时，为了方便读者，本书末以附录的形式介绍了农业土壤环境与农产品安全相关的国家标准、法律和法规。
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